| Gene | Accession number | Functional annotation | Reference | Controlling trait | P-value | Haplotype | 688Coincidence | Sequence | |||||
| MYB14 | Glyma.15G259400 | MYB transcription factor MYB14 | Liu et al., 2021b | Yield | 0.04819 | freq | hap | Chr15__49187630 | yeild | FAM | TGCTGTTGAGCCAGAAATGGA | ||
| 438 | Hap1 | A | HIGH | 239/278 | 85.97% | HEX | TGCTGTTGAGCCAGAAATGGG | ||||||
| 214 | Hap2 | G | LOW | 126/193 | 65.28% | R | GAGGGCAAGAGGGCCATAATTG | ||||||
| sample_name | Chr15__49187630 | sample_name | FAM | sample_name | Chr15__49187630 | sample_name | HEX | ||||||
| 369 | A | 369 | A:A | 391 | G | 405 | G:G | ||||||
| 390 | A | 390 | A:A | 405 | G | 413 | G:G | ||||||
| 401 | A | 401 | A:A | 407 | G | 432 | G:G | ||||||
| 442 | A | C10 | A:A | 411 | G | A3 | G:G | ||||||
| 458 | A | C2 | A:A | 413 | G | B4 | G:G | ||||||
| A2 | A | C22 | A:A | 432 | G | C1124 | G:G | ||||||
| B6 | A | C32 | A:A | 438 | G | C1137 | G:G | ||||||
| B8 | A | C4 | A:A | A3 | G | C15 | G:G | ||||||
| C10 | A | C40 | A:A | A4 | G | C36 | G:G | ||||||
| C2 | A | C42 | A:A | B4 | G | C8 | G:G | ||||||
| C22 | A | C43 | A:A | B5 | G | C881 | G:G | ||||||
| C25 | A | C884 | A:A | C1124 | G | CX101 | G:G | ||||||
| C26 | A | C9 | A:A | C1137 | G | CX104 | G:G | ||||||
| C32 | A | CX1 | A:A | C12 | G | CX105 | G:G | ||||||
| C4 | A | CX108 | A:A | C15 | G | CX106 | G:G | ||||||
| C40 | A | CX113 | A:A | C20 | G | CX110 | G:G | ||||||
| C42 | A | CX115 | A:A | C23 | G | CX13 | G:G | ||||||
| C43 | A | CX119 | A:A | C24 | G | CX131 | G:G | ||||||
| C45 | A | CX123 | A:A | C28 | G | CX138 | G:G | ||||||
| C619 | A | CX124 | A:A | C30 | G | CX141 | G:G | ||||||
| C884 | A | CX132 | A:A | C36 | G | CX142 | G:G | ||||||
| C9 | A | CX134 | A:A | C38 | G | CX154 | G:G | ||||||
| CX1 | A | CX135 | A:A | C39 | G | CX155 | G:G | ||||||
| CX107 | A | CX136 | A:A | C41 | G | CX156 | G:G | ||||||
| CX108 | A | CX137 | A:A | C44 | G | CX157 | G:G | ||||||
| CX11 | A | CX139 | A:A | C6 | G | CX158 | G:G | ||||||
| CX112 | A | CX140 | A:A | C7 | G | CX159 | G:G | ||||||
| CX113 | A | CX143 | A:A | C8 | G | CX160 | G:G | ||||||
| CX114 | A | CX145 | A:A | C821 | G | CX163 | G:G | ||||||
| CX115 | A | CX146 | A:A | C881 | G | CX168 | G:G | ||||||
| CX116 | A | CX150 | A:A | CX101 | G | CX169 | G:G | ||||||
| CX117 | A | CX151 | A:A | CX103 | G | CX17 | G:G | ||||||
| CX118 | A | CX152 | A:A | CX104 | G | CX171 | G:G | ||||||
| CX119 | A | CX153 | A:A | CX105 | G | CX172 | G:G | ||||||
| CX121 | A | CX162 | A:A | CX106 | G | CX173 | G:G | ||||||
| CX122 | A | CX170 | A:A | CX109 | G | CX184 | G:G | ||||||
| CX123 | A | CX178 | A:A | CX110 | G | CX185 | G:G | ||||||
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| CX132 | A | CX183 | A:A | CX130 | G | CX213 | G:G | ||||||
| CX133 | A | CX19 | A:A | CX131 | G | CX221 | G:G | ||||||
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| CX195 | A | CX299 | A:A | CX24 | G | JL012 | G:G | ||||||
| CX197 | A | CX300 | A:A | CX242 | G | JL013 | G:G | ||||||
| CX199 | A | CX312 | A:A | CX248 | G | JL017 | G:G | ||||||
| CX2 | A | CX316 | A:A | CX26 | G | JL033 | G:G | ||||||
| CX20 | A | CX317 | A:A | CX263 | G | JL034 | G:G | ||||||
| CX200 | A | CX319 | A:A | CX267 | G | JL036 | G:G | ||||||
| CX201 | A | CX32 | A:A | CX273 | G | JL051 | G:G | ||||||
| CX202 | A | CX322 | A:A | CX274 | G | JL065 | G:G | ||||||
| CX203 | A | CX324 | A:A | CX276 | G | JL066 | G:G | ||||||
| CX204 | A | CX35 | A:A | CX277 | G | JL067 | G:G | ||||||
| CX205 | A | CX36 | A:A | CX280 | G | JL068 | G:G | ||||||
| CX207 | A | CX39 | A:A | CX281 | G | JL084 | G:G | ||||||
| CX21 | A | CX5 | A:A | CX284 | G | JL096 | G:G | ||||||
| CX210 | A | CX50 | A:A | CX288 | G | JL099 | G:G | ||||||
| CX211 | A | CX6 | A:A | CX29 | G | JL106 | G:G | ||||||
| CX212 | A | CX64 | A:A | CX295 | G | JL108 | G:G | ||||||
| CX214 | A | CX8 | A:A | CX3 | G | JL113 | G:G | ||||||
| CX215 | A | CX84 | A:A | CX302 | G | JL211 | G:G | ||||||
| CX216 | A | H166 | A:A | CX305 | G | JL224 | G:G | ||||||
| CX217 | A | H660 | A:A | CX306 | G | JL225 | G:G | ||||||
| CX218 | A | JL001 | A:A | CX310 | G | JL234 | G:G | ||||||
| CX219 | A | JL002 | A:A | CX311 | G | JL237 | G:G | ||||||
| CX22 | A | JL003 | A:A | CX314 | G | JL238 | G:G | ||||||
| CX222 | A | JL004 | A:A | CX315 | G | JL243 | G:G | ||||||
| CX230 | A | JL006 | A:A | CX318 | G | JL245 | G:G | ||||||
| CX243 | A | JL011 | A:A | CX321 | G | JL247 | G:G | ||||||
| CX246 | A | JL015 | A:A | CX323 | G | JL255 | G:G | ||||||
| CX247 | A | JL018 | A:A | CX326 | G | JL260 | G:G | ||||||
| CX249 | A | JL020 | A:A | CX327 | G | JL268 | G:G | ||||||
| CX250 | A | JL021 | A:A | CX328 | G | JL269 | G:G | ||||||
| CX251 | A | JL023 | A:A | CX34 | G | JL270 | G:G | ||||||
| CX253 | A | JL024 | A:A | CX45 | G | JL271 | G:G | ||||||
| CX254 | A | JL025 | A:A | CX47 | G | JL273 | G:G | ||||||
| CX256 | A | JL026 | A:A | CX48 | G | JL282 | G:G | ||||||
| CX257 | A | JL030 | A:A | CX52 | G | JL288 | G:G | ||||||
| CX258 | A | JL031 | A:A | CX53 | G | JL294 | G:G | ||||||
| CX259 | A | JL035 | A:A | CX54 | G | JL299 | G:G | ||||||
| CX261 | A | JL037 | A:A | CX57 | G | JL301 | G:G | ||||||
| CX262 | A | JL038 | A:A | CX59 | G | JL302 | G:G | ||||||
| CX264 | A | JL041 | A:A | CX61 | G | JL303 | G:G | ||||||
| CX265 | A | JL042 | A:A | CX65 | G | JL327 | G:G | ||||||
| CX268 | A | JL043 | A:A | CX76 | G | JL334 | G:G | ||||||
| CX269 | A | JL045 | A:A | CX78 | G | JL337 | G:G | ||||||
| CX27 | A | JL046 | A:A | CX90 | G | JL343 | G:G | ||||||
| CX270 | A | JL047 | A:A | CX91 | G | JL347 | G:G | ||||||
| CX271 | A | JL048 | A:A | CX92 | G | JL348 | G:G | ||||||
| CX272 | A | JL049 | A:A | CX93 | G | ||||||||
| CX275 | A | JL050 | A:A | CX94 | G | ||||||||
| CX278 | A | JL052 | A:A | CX95 | G | ||||||||
| CX279 | A | JL053 | A:A | E2 | G | ||||||||
| CX28 | A | JL055 | A:A | E4 | G | ||||||||
| CX282 | A | JL057 | A:A | H101 | G | ||||||||
| CX283 | A | JL059 | A:A | H542 | G | ||||||||
| CX285 | A | JL060 | A:A | H750 | G | ||||||||
| CX287 | A | JL062 | A:A | H751 | G | ||||||||
| CX290 | A | JL063 | A:A | H760 | G | ||||||||
| CX291 | A | JL064 | A:A | JL005 | G | ||||||||
| CX292 | A | JL070 | A:A | JL007 | G | ||||||||
| CX293 | A | JL071 | A:A | JL008 | G | ||||||||
| CX294 | A | JL072 | A:A | JL009 | G | ||||||||
| CX296 | A | JL073 | A:A | JL010 | G | ||||||||
| CX298 | A | JL075 | A:A | JL012 | G | ||||||||
| CX299 | A | JL076 | A:A | JL013 | G | ||||||||
| CX30 | A | JL079 | A:A | JL017 | G | ||||||||
| CX300 | A | JL080 | A:A | JL027 | G | ||||||||
| CX301 | A | JL081 | A:A | JL033 | G | ||||||||
| CX303 | A | JL082 | A:A | JL034 | G | ||||||||
| CX304 | A | JL083 | A:A | JL036 | G | ||||||||
| CX307 | A | JL085 | A:A | JL040 | G | ||||||||
| CX308 | A | JL086 | A:A | JL044 | G | ||||||||
| CX309 | A | JL088 | A:A | JL051 | G | ||||||||
| CX31 | A | JL089 | A:A | JL054 | G | ||||||||
| CX312 | A | JL090 | A:A | JL065 | G | ||||||||
| CX313 | A | JL092 | A:A | JL066 | G | ||||||||
| CX316 | A | JL095 | A:A | JL067 | G | ||||||||
| CX317 | A | JL097 | A:A | JL068 | G | ||||||||
| CX319 | A | JL100 | A:A | JL074 | G | ||||||||
| CX32 | A | JL102 | A:A | JL084 | G | ||||||||
| CX320 | A | JL103 | A:A | JL087 | G | ||||||||
| CX322 | A | JL104 | A:A | JL096 | G | ||||||||
| CX324 | A | JL162 | A:A | JL098 | G | ||||||||
| CX325 | A | JL192 | A:A | JL099 | G | ||||||||
| CX329 | A | JL208 | A:A | JL106 | G | ||||||||
| CX33 | A | JL209 | A:A | JL108 | G | ||||||||
| CX35 | A | JL212 | A:A | JL109 | G | ||||||||
| CX36 | A | JL213 | A:A | JL113 | G | ||||||||
| CX38 | A | JL214 | A:A | JL114 | G | ||||||||
| CX39 | A | JL215 | A:A | JL120 | G | ||||||||
| CX4 | A | JL216 | A:A | JL129 | G | ||||||||
| CX41 | A | JL217 | A:A | JL133 | G | ||||||||
| CX42 | A | JL218 | A:A | JL139 | G | ||||||||
| CX43 | A | JL219 | A:A | JL141 | G | ||||||||
| CX44 | A | JL220 | A:A | JL150 | G | ||||||||
| CX49 | A | JL221 | A:A | JL151 | G | ||||||||
| CX5 | A | JL222 | A:A | JL160 | G | ||||||||
| CX50 | A | JL223 | A:A | JL166 | G | ||||||||
| CX55 | A | JL226 | A:A | JL167 | G | ||||||||
| CX6 | A | JL227 | A:A | JL168 | G | ||||||||
| CX63 | A | JL228 | A:A | JL169 | G | ||||||||
| CX64 | A | JL229 | A:A | JL171 | G | ||||||||
| CX66 | A | JL230 | A:A | JL186 | G | ||||||||
| CX67 | A | JL231 | A:A | JL188 | G | ||||||||
| CX68 | A | JL232 | A:A | JL189 | G | ||||||||
| CX71 | A | JL233 | A:A | JL194 | G | ||||||||
| CX74 | A | JL235 | A:A | JL195 | G | ||||||||
| CX8 | A | JL239 | A:A | JL210 | G | ||||||||
| CX80 | A | JL240 | A:A | JL211 | G | ||||||||
| CX83 | A | JL241 | A:A | JL224 | G | ||||||||
| CX84 | A | JL242 | A:A | JL225 | G | ||||||||
| CX9 | A | JL246 | A:A | JL234 | G | ||||||||
| CX96 | A | JL248 | A:A | JL236 | G | ||||||||
| CX98 | A | JL249 | A:A | JL237 | G | ||||||||
| E1 | A | JL250 | A:A | JL238 | G | ||||||||
| F6 | A | JL251 | A:A | JL243 | G | ||||||||
| H166 | A | JL253 | A:A | JL245 | G | ||||||||
| H335 | A | JL254 | A:A | JL247 | G | ||||||||
| H450 | A | JL256 | A:A | JL255 | G | ||||||||
| H601 | A | JL257 | A:A | JL260 | G | ||||||||
| H660 | A | JL258 | A:A | JL268 | G | ||||||||
| H663 | A | JL259 | A:A | JL269 | G | ||||||||
| H681 | A | JL261 | A:A | JL270 | G | ||||||||
| H726 | A | JL263 | A:A | JL271 | G | ||||||||
| JL001 | A | JL264 | A:A | JL273 | G | ||||||||
| JL002 | A | JL265 | A:A | JL279 | G | ||||||||
| JL003 | A | JL266 | A:A | JL282 | G | ||||||||
| JL004 | A | JL267 | A:A | JL283 | G | ||||||||
| JL006 | A | JL272 | A:A | JL288 | G | ||||||||
| JL011 | A | JL274 | A:A | JL291 | G | ||||||||
| JL014 | A | JL275 | A:A | JL294 | G | ||||||||
| JL015 | A | JL277 | A:A | JL299 | G | ||||||||
| JL016 | A | JL280 | A:A | JL301 | G | ||||||||
| JL018 | A | JL281 | A:A | JL302 | G | ||||||||
| JL019 | A | JL285 | A:A | JL303 | G | ||||||||
| JL020 | A | JL286 | A:A | JL306 | G | ||||||||
| JL021 | A | JL287 | A:A | JL309 | G | ||||||||
| JL022 | A | JL289 | A:A | JL313 | G | ||||||||
| JL023 | A | JL290 | A:A | JL318 | G | ||||||||
| JL024 | A | JL293 | A:A | JL319 | G | ||||||||
| JL025 | A | JL295 | A:A | JL327 | G | ||||||||
| JL026 | A | JL297 | A:A | JL334 | G | ||||||||
| JL028 | A | JL298 | A:A | JL337 | G | ||||||||
| JL029 | A | JL300 | A:A | JL338 | G | ||||||||
| JL030 | A | JL304 | A:A | JL343 | G | ||||||||
| JL031 | A | JL305 | A:A | JL347 | G | ||||||||
| JL032 | A | JL314 | A:A | JL348 | G | ||||||||
| JL035 | A | JL315 | A:A | ||||||||||
| JL037 | A | JL317 | A:A | ||||||||||
| JL038 | A | JL321 | A:A | ||||||||||
| JL039 | A | JL324 | A:A | ||||||||||
| JL041 | A | JL325 | A:A | ||||||||||
| JL042 | A | JL326 | A:A | ||||||||||
| JL043 | A | JL328 | A:A | ||||||||||
| JL045 | A | JL333 | A:A | ||||||||||
| JL046 | A | JL335 | A:A | ||||||||||
| JL047 | A | JL339 | A:A | ||||||||||
| JL048 | A | JL341 | A:A | ||||||||||
| JL049 | A | JL345 | A:A | ||||||||||
| JL050 | A | JL346 | A:A | ||||||||||
| JL052 | A | JL349 | A:A | ||||||||||
| JL053 | A | ||||||||||||
| JL055 | A | ||||||||||||
| JL056 | A | ||||||||||||
| JL057 | A | ||||||||||||
| JL058 | A | ||||||||||||
| JL059 | A | ||||||||||||
| JL060 | A | ||||||||||||
| JL061 | A | ||||||||||||
| JL062 | A | ||||||||||||
| JL063 | A | ||||||||||||
| JL064 | A | ||||||||||||
| JL069 | A | ||||||||||||
| JL070 | A | ||||||||||||
| JL071 | A | ||||||||||||
| JL072 | A | ||||||||||||
| JL073 | A | ||||||||||||
| JL075 | A | ||||||||||||
| JL076 | A | ||||||||||||
| JL077 | A | ||||||||||||
| JL078 | A | ||||||||||||
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