| Gene | Accessionnumber | Functionalannotation | Reference | Controllingtrait | P-value | Haplotype | 688Coincidencerate | Sequence | ||||||
| GmPDAT | Glyma.13G108100 | REGULATOR OF CHROMOSOME CONDENSATION | Liu et al. 2020a; Liu et al. 2020b | Seed quality (oil content) | 0.04737 | freq | hap | Chr13__22247900 | oil | FAM | TTGGCACCGCATCCAGAAACC | |||
| 160 | Hap5 | G | LOW | 202/258 | 78.29% | HEX | TTGGCACCGCATCCAGAAACA | |||||||
| 198 | Hap1 | T | HIGH | 203/311 | 65.27% | R | GAAAGGGATTTCAGATTCGGACACG | |||||||
| 下机 | 测序 | 下机 | 测序 | |||||||||||
| Sample Name | O81 | A | Sample Name | Chr13__22247900 | hap | Sample Name | O81 | C | Sample Name | Chr13__22247900 | hap | |||
| 413 | A:A | 1.00 | 203.00 | 369 | T | Hap1 | 405 | C:C | 1.00 | 202.00 | 391 | G | Hap2 | |
| A3 | A:A | 1.00 | 311 | 390 | T | Hap1 | 432 | C:C | 1.00 | 258 | 405 | G | Hap2 | |
| B4 | A:A | 1.00 | 203/311 | 401 | T | Hap1 | C15 | C:C | 1.00 | 202/258 | 407 | G | Hap3 | |
| C10 | A:A | 1.00 | 413 | T | Hap1 | C2 | C:C | 1.00 | 411 | G | Hap4 | |||
| C22 | A:A | 1.00 | 438 | T | Hap1 | C881 | C:C | 1.00 | 432 | G | Hap2 | |||
| C25 | A:A | 1.00 | 442 | T | Hap1 | CX103 | C:C | 1.00 | 458 | G | Hap5 | |||
| C26 | A:A | 1.00 | A3 | T | Hap1 | CX104 | C:C | 1.00 | A2 | G | Hap2 | |||
| C36 | A:A | 1.00 | B4 | T | Hap1 | CX105 | C:C | 1.00 | A4 | G | Hap2 | |||
| C4 | A:A | 1.00 | B5 | T | Hap1 | CX108 | C:C | 1.00 | B6 | G | Hap4 | |||
| C42 | A:A | 1.00 | B8 | T | Hap6 | CX113 | C:C | 1.00 | C1124 | G | Hap2 | |||
| C43 | A:A | 1.00 | C10 | T | Hap1 | CX119 | C:C | 1.00 | C1137 | G | Hap2 | |||
| C7 | A:A | 1.00 | C12 | T | Hap1 | CX123 | C:C | 1.00 | C15 | G | Hap2 | |||
| C9 | A:A | 1.00 | C20 | T | Hap6 | CX124 | C:C | 1.00 | C2 | G | Hap5 | |||
| CX1 | A:A | 1.00 | C22 | T | Hap7 | CX135 | C:C | 1.00 | C24 | G | Hap4 | |||
| CX110 | A:A | 1.00 | C23 | T | Hap6 | CX136 | C:C | 1.00 | C28 | G | Hap2 | |||
| CX127 | A:A | 1.00 | C25 | T | Hap1 | CX138 | C:C | 1.00 | C32 | G | Hap4 | |||
| CX13 | A:A | 1.00 | C26 | T | Hap7 | CX139 | C:C | 1.00 | C38 | G | Hap2 | |||
| CX130 | A:A | 1.00 | C30 | T | Hap1 | CX143 | C:C | 1.00 | C39 | G | Hap2 | |||
| CX134 | A:A | 1.00 | C36 | T | Hap6 | CX146 | C:C | 1.00 | C41 | G | Hap2 | |||
| CX137 | A:A | 1.00 | C4 | T | Hap1 | CX150 | C:C | 1.00 | C44 | G | Hap5 | |||
| CX140 | A:A | 1.00 | C40 | T | Hap1 | CX152 | C:C | 1.00 | C45 | G | Hap2 | |||
| CX141 | A:A | 1.00 | C42 | T | Hap7 | CX153 | C:C | 1.00 | C881 | G | Hap2 | |||
| CX142 | A:A | 1.00 | C43 | T | Hap6 | CX158 | C:C | 1.00 | CX101 | G | Hap5 | |||
| CX145 | A:A | 1.00 | C6 | T | Hap7 | CX160 | C:C | 1.00 | CX103 | G | Hap5 | |||
| CX148 | A:A | 1.00 | C619 | T | Hap1 | CX168 | C:C | 1.00 | CX104 | G | Hap5 | |||
| CX154 | A:A | 1.00 | C7 | T | Hap1 | CX169 | C:C | 1.00 | CX105 | G | Hap5 | |||
| CX155 | A:A | 1.00 | C8 | T | Hap6 | CX171 | C:C | 1.00 | CX106 | G | Hap5 | |||
| CX156 | A:A | 1.00 | C821 | T | Hap6 | CX172 | C:C | 1.00 | CX107 | G | Hap5 | |||
| CX159 | A:A | 1.00 | C884 | T | Hap6 | CX18 | C:C | 1.00 | CX108 | G | Hap5 | |||
| CX161 | A:A | 1.00 | C9 | T | Hap1 | CX180 | C:C | 1.00 | CX109 | G | Hap5 | |||
| CX162 | A:A | 1.00 | CX1 | T | Hap8 | CX181 | C:C | 1.00 | CX112 | G | Hap5 | |||
| CX163 | A:A | 1.00 | CX11 | T | Hap6 | CX184 | C:C | 1.00 | CX113 | G | Hap5 | |||
| CX17 | A:A | 1.00 | CX110 | T | Hap7 | CX185 | C:C | 1.00 | CX114 | G | Hap5 | |||
| CX178 | A:A | 1.00 | CX12 | T | Hap6 | CX196 | C:C | 1.00 | CX115 | G | Hap3 | |||
| CX183 | A:A | 1.00 | CX122 | T | Hap7 | CX197 | C:C | 1.00 | CX116 | G | Hap5 | |||
| CX205 | A:A | 1.00 | CX127 | T | Hap7 | CX20 | C:C | 1.00 | CX117 | G | Hap5 | |||
| CX213 | A:A | 1.00 | CX13 | T | Hap1 | CX201 | C:C | 1.00 | CX118 | G | Hap5 | |||
| CX217 | A:A | 1.00 | CX130 | T | Hap1 | CX202 | C:C | 1.00 | CX119 | G | Hap5 | |||
| CX220 | A:A | 1.00 | CX134 | T | Hap1 | CX204 | C:C | 1.00 | CX120 | G | Hap5 | |||
| CX228 | A:A | 1.00 | CX137 | T | Hap1 | CX211 | C:C | 1.00 | CX121 | G | Hap5 | |||
| CX235 | A:A | 1.00 | CX140 | T | Hap6 | CX215 | C:C | 1.00 | CX123 | G | Hap5 | |||
| CX24 | A:A | 1.00 | CX141 | T | Hap6 | CX218 | C:C | 1.00 | CX124 | G | Hap5 | |||
| CX246 | A:A | 1.00 | CX142 | T | Hap7 | CX221 | C:C | 1.00 | CX126 | G | Hap5 | |||
| CX248 | A:A | 1.00 | CX145 | T | Hap7 | CX222 | C:C | 1.00 | CX128 | G | Hap5 | |||
| CX249 | A:A | 1.00 | CX148 | T | Hap6 | CX225 | C:C | 1.00 | CX129 | G | Hap5 | |||
| CX250 | A:A | 1.00 | CX154 | T | Hap1 | CX243 | C:C | 1.00 | CX131 | G | Hap5 | |||
| CX26 | A:A | 1.00 | CX155 | T | Hap1 | CX247 | C:C | 1.00 | CX132 | G | Hap4 | |||
| CX261 | A:A | 1.00 | CX156 | T | Hap6 | CX257 | C:C | 1.00 | CX133 | G | Hap2 | |||
| CX268 | A:A | 1.00 | CX159 | T | Hap1 | CX267 | C:C | 1.00 | CX135 | G | Hap5 | |||
| CX273 | A:A | 1.00 | CX161 | T | Hap1 | CX269 | C:C | 1.00 | CX136 | G | Hap5 | |||
| CX274 | A:A | 1.00 | CX162 | T | Hap1 | CX271 | C:C | 1.00 | CX138 | G | Hap5 | |||
| CX275 | A:A | 1.00 | CX163 | T | Hap1 | CX272 | C:C | 1.00 | CX139 | G | Hap2 | |||
| CX29 | A:A | 1.00 | CX164 | T | Hap1 | CX276 | C:C | 1.00 | CX14 | G | Hap2 | |||
| CX291 | A:A | 1.00 | CX167 | T | Hap7 | CX277 | C:C | 1.00 | CX143 | G | Hap2 | |||
| CX3 | A:A | 1.00 | CX17 | T | Hap7 | CX28 | C:C | 1.00 | CX144 | G | Hap2 | |||
| CX313 | A:A | 1.00 | CX170 | T | Hap8 | CX283 | C:C | 1.00 | CX146 | G | Hap2 | |||
| CX314 | A:A | 1.00 | CX173 | T | Hap1 | CX285 | C:C | 1.00 | CX147 | G | Hap5 | |||
| CX316 | A:A | 1.00 | CX176 | T | Hap7 | CX287 | C:C | 1.00 | CX149 | G | Hap2 | |||
| CX317 | A:A | 1.00 | CX178 | T | Hap6 | CX30 | C:C | 1.00 | CX150 | G | Hap5 | |||
| CX318 | A:A | 1.00 | CX179 | T | Hap1 | CX307 | C:C | 1.00 | CX151 | G | Hap2 | |||
| CX32 | A:A | 1.00 | CX183 | T | Hap1 | CX309 | C:C | 1.00 | CX152 | G | Hap9 | |||
| CX324 | A:A | 1.00 | CX187 | T | Hap1 | CX319 | C:C | 1.00 | CX153 | G | Hap3 | |||
| CX326 | A:A | 1.00 | CX190 | T | Hap1 | CX323 | C:C | 1.00 | CX157 | G | Hap2 | |||
| CX328 | A:A | 1.00 | CX193 | T | Hap1 | CX35 | C:C | 1.00 | CX158 | G | Hap2 | |||
| CX33 | A:A | 1.00 | CX195 | T | Hap1 | CX42 | C:C | 1.00 | CX160 | G | Hap2 | |||
| CX4 | A:A | 1.00 | CX205 | T | Hap1 | CX47 | C:C | 1.00 | CX165 | G | Hap2 | |||
| CX48 | A:A | 1.00 | CX210 | T | Hap1 | CX49 | C:C | 1.00 | CX168 | G | Hap5 | |||
| CX5 | A:A | 1.00 | CX213 | T | Hap1 | CX50 | C:C | 1.00 | CX169 | G | Hap4 | |||
| CX53 | A:A | 1.00 | CX217 | T | Hap1 | CX68 | C:C | 1.00 | CX171 | G | Hap2 | |||
| CX6 | A:A | 1.00 | CX220 | T | Hap1 | CX78 | C:C | 1.00 | CX172 | G | Hap2 | |||
| CX64 | A:A | 1.00 | CX228 | T | Hap1 | CX90 | C:C | 1.00 | CX174 | G | Hap2 | |||
| CX66 | A:A | 1.00 | CX235 | T | Hap1 | CX91 | C:C | 1.00 | CX175 | G | Hap3 | |||
| CX74 | A:A | 1.00 | CX24 | T | Hap8 | CX92 | C:C | 1.00 | CX177 | G | Hap2 | |||
| CX76 | A:A | 1.00 | CX246 | T | Hap1 | CX94 | C:C | 1.00 | CX18 | G | Hap2 | |||
| CX8 | A:A | 1.00 | CX248 | T | Hap1 | H660 | C:C | 1.00 | CX180 | G | Hap2 | |||
| CX80 | A:A | 1.00 | CX249 | T | Hap7 | H681 | C:C | 1.00 | CX181 | G | Hap5 | |||
| CX84 | A:A | 1.00 | CX250 | T | Hap7 | H750 | C:C | 1.00 | CX182 | G | Hap5 | |||
| CX93 | A:A | 1.00 | CX251 | T | Hap1 | JL009 | C:C | 1.00 | CX184 | G | Hap5 | |||
| CX96 | A:A | 1.00 | CX253 | T | Hap7 | JL014 | C:C | 1.00 | CX185 | G | Hap5 | |||
| H542 | A:A | 1.00 | CX254 | T | Hap1 | JL015 | C:C | 1.00 | CX186 | G | Hap4 | |||
| H751 | A:A | 1.00 | CX26 | T | Hap1 | JL016 | C:C | 1.00 | CX188 | G | Hap4 | |||
| H760 | A:A | 1.00 | CX261 | T | Hap6 | JL017 | C:C | 1.00 | CX189 | G | Hap2 | |||
| JL001 | A:A | 1.00 | CX262 | T | Hap1 | JL019 | C:C | 1.00 | CX19 | G | Hap5 | |||
| JL003 | A:A | 1.00 | CX268 | T | Hap8 | JL021 | C:C | 1.00 | CX191 | G | Hap5 | |||
| JL007 | A:A | 1.00 | CX270 | T | Hap1 | JL029 | C:C | 1.00 | CX192 | G | Hap4 | |||
| JL008 | A:A | 1.00 | CX273 | T | Hap1 | JL031 | C:C | 1.00 | CX194 | G | Hap5 | |||
| JL010 | A:A | 1.00 | CX274 | T | Hap6 | JL032 | C:C | 1.00 | CX196 | G | Hap5 | |||
| JL012 | A:A | 1.00 | CX275 | T | Hap1 | JL034 | C:C | 1.00 | CX197 | G | Hap5 | |||
| JL018 | A:A | 1.00 | CX279 | T | Hap7 | JL037 | C:C | 1.00 | CX198 | G | Hap5 | |||
| JL022 | A:A | 1.00 | CX280 | T | Hap6 | JL038 | C:C | 1.00 | CX199 | G | Hap5 | |||
| JL024 | A:A | 1.00 | CX282 | T | Hap6 | JL043 | C:C | 1.00 | CX2 | G | Hap5 | |||
| JL027 | A:A | 1.00 | CX29 | T | Hap7 | JL045 | C:C | 1.00 | CX20 | G | Hap4 | |||
| JL030 | A:A | 1.00 | CX291 | T | Hap1 | JL046 | C:C | 1.00 | CX200 | G | Hap5 | |||
| JL033 | A:A | 1.00 | CX292 | T | Hap1 | JL047 | C:C | 1.00 | CX201 | G | Hap5 | |||
| JL036 | A:A | 1.00 | CX293 | T | Hap1 | JL051 | C:C | 1.00 | CX202 | G | Hap9 | |||
| JL039 | A:A | 1.00 | CX295 | T | Hap1 | JL062 | C:C | 1.00 | CX203 | G | Hap10 | |||
| JL041 | A:A | 1.00 | CX298 | T | Hap1 | JL066 | C:C | 1.00 | CX204 | G | Hap5 | |||
| JL048 | A:A | 1.00 | CX299 | T | Hap7 | JL067 | C:C | 1.00 | CX206 | G | Hap2 | |||
| JL050 | A:A | 1.00 | CX3 | T | Hap1 | JL068 | C:C | 1.00 | CX207 | G | Hap2 | |||
| JL052 | A:A | 1.00 | CX305 | T | Hap7 | JL069 | C:C | 1.00 | CX209 | G | Hap2 | |||
| JL053 | A:A | 1.00 | CX306 | T | Hap7 | JL070 | C:C | 1.00 | CX21 | G | Hap10 | |||
| JL054 | A:A | 1.00 | CX308 | T | Hap1 | JL071 | C:C | 1.00 | CX211 | G | Hap5 | |||
| JL057 | A:A | 1.00 | CX31 | T | Hap1 | JL075 | C:C | 1.00 | CX212 | G | Hap2 | |||
| JL059 | A:A | 1.00 | CX310 | T | Hap8 | JL076 | C:C | 1.00 | CX214 | G | Hap11 | |||
| JL060 | A:A | 1.00 | CX311 | T | Hap8 | JL079 | C:C | 1.00 | CX215 | G | Hap5 | |||
| JL061 | A:A | 1.00 | CX312 | T | Hap1 | JL081 | C:C | 1 | CX216 | G | Hap5 | |||
| JL063 | A:A | 1.00 | CX313 | T | Hap7 | JL082 | C:C | 1 | CX218 | G | Hap2 | |||
| JL064 | A:A | 1.00 | CX314 | T | Hap1 | JL084 | C:C | 1 | CX219 | G | Hap4 | |||
| JL065 | A:A | 1.00 | CX316 | T | Hap8 | JL095 | C:C | 1 | CX22 | G | Hap5 | |||
| JL072 | A:A | 1.00 | CX317 | T | Hap7 | JL096 | C:C | 1 | CX221 | G | Hap2 | |||
| JL073 | A:A | 1.00 | CX318 | T | Hap7 | JL097 | C:C | 1 | CX222 | G | Hap5 | |||
| JL080 | A:A | 1.00 | CX32 | T | Hap1 | JL098 | C:C | 1 | CX225 | G | Hap2 | |||
| JL083 | A:A | 1.00 | CX324 | T | Hap1 | JL099 | C:C | 1 | CX230 | G | Hap2 | |||
| JL085 | A:A | 1.00 | CX325 | T | Hap1 | JL102 | C:C | 1 | CX242 | G | Hap4 | |||
| JL089 | A:A | 1.00 | CX326 | T | Hap7 | JL113 | C:C | 1 | CX243 | G | Hap2 | |||
| JL091 | A:A | 1.00 | CX328 | T | Hap1 | JL119 | C:C | 1 | CX247 | G | Hap5 | |||
| JL103 | A:A | 1.00 | CX329 | T | Hap1 | JL122 | C:C | 1 | CX256 | G | Hap12 | |||
| JL104 | A:A | 1.00 | CX33 | T | Hap1 | JL123 | C:C | 1 | CX257 | G | Hap11 | |||
| JL105 | A:A | 1.00 | CX34 | T | Hap7 | JL124 | C:C | 1 | CX258 | G | Hap9 | |||
| JL109 | A:A | 1.00 | CX4 | T | Hap7 | JL126 | C:C | 1 | CX259 | G | Hap9 | |||
| JL114 | A:A | 1.00 | CX44 | T | Hap1 | JL132 | C:C | 1 | CX263 | G | Hap3 | |||
| JL115 | A:A | 1.00 | CX48 | T | Hap1 | JL136 | C:C | 1 | CX264 | G | Hap2 | |||
| JL116 | A:A | 1.00 | CX5 | T | Hap1 | JL137 | C:C | 1 | CX265 | G | Hap2 | |||
| JL121 | A:A | 1.00 | CX53 | T | Hap1 | JL138 | C:C | 1 | CX267 | G | Hap5 | |||
| JL129 | A:A | 1.00 | CX54 | T | Hap1 | JL139 | C:C | 1 | CX269 | G | Hap5 | |||
| JL131 | A:A | 1.00 | CX6 | T | Hap1 | JL140 | C:C | 1 | CX27 | G | Hap5 | |||
| JL142 | A:A | 1.00 | CX64 | T | Hap7 | JL141 | C:C | 1 | CX271 | G | Hap5 | |||
| JL143 | A:A | 1.00 | CX65 | T | Hap6 | JL144 | C:C | 1 | CX272 | G | Hap5 | |||
| JL146 | A:A | 1.00 | CX66 | T | Hap1 | JL145 | C:C | 1 | CX276 | G | Hap3 | |||
| JL148 | A:A | 1.00 | CX74 | T | Hap1 | JL149 | C:C | 1 | CX277 | G | Hap5 | |||
| JL153 | A:A | 1.00 | CX76 | T | Hap8 | JL151 | C:C | 1 | CX278 | G | Hap2 | |||
| JL154 | A:A | 1.00 | CX8 | T | Hap1 | JL152 | C:C | 1 | CX28 | G | Hap11 | |||
| JL155 | A:A | 1.00 | CX80 | T | Hap1 | JL159 | C:C | 1 | CX281 | G | Hap4 | |||
| JL156 | A:A | 1.00 | CX83 | T | Hap7 | JL161 | C:C | 1 | CX283 | G | Hap5 | |||
| JL162 | A:A | 1.00 | CX84 | T | Hap1 | JL166 | C:C | 1 | CX284 | G | Hap5 | |||
| JL164 | A:A | 1.00 | CX9 | T | Hap6 | JL167 | C:C | 1 | CX285 | G | Hap9 | |||
| JL165 | A:A | 1.00 | CX93 | T | Hap8 | JL170 | C:C | 1 | CX287 | G | Hap2 | |||
| JL171 | A:A | 1.00 | CX96 | T | Hap1 | JL175 | C:C | 1 | CX288 | G | Hap2 | |||
| JL172 | A:A | 1.00 | E1 | T | Hap7 | JL179 | C:C | 1 | CX290 | G | Hap5 | |||
| JL173 | A:A | 1.00 | F6 | T | Hap8 | JL181 | C:C | 1 | CX294 | G | Hap5 | |||
| JL176 | A:A | 1.00 | H335 | T | Hap1 | JL182 | C:C | 1 | CX296 | G | Hap2 | |||
| JL178 | A:A | 1.00 | H450 | T | Hap1 | JL187 | C:C | 1 | CX30 | G | Hap5 | |||
| JL180 | A:A | 1.00 | H542 | T | Hap1 | JL188 | C:C | 1 | CX300 | G | Hap3 | |||
| JL184 | A:A | 1.00 | H726 | T | Hap1 | JL193 | C:C | 1 | CX301 | G | Hap2 | |||
| JL186 | A:A | 1.00 | H751 | T | Hap1 | JL197 | C:C | 1 | CX302 | G | Hap4 | |||
| JL190 | A:A | 1.00 | H760 | T | Hap1 | JL198 | C:C | 1 | CX303 | G | Hap2 | |||
| JL191 | A:A | 1.00 | JL001 | T | Hap7 | JL201 | C:C | 1 | CX304 | G | Hap2 | |||
| JL192 | A:A | 1.00 | JL002 | T | Hap1 | JL202 | C:C | 1 | CX307 | G | Hap2 | |||
| JL194 | A:A | 1.00 | JL003 | T | Hap1 | JL203 | C:C | 1 | CX309 | G | Hap2 | |||
| JL195 | A:A | 1.00 | JL006 | T | Hap8 | JL208 | C:C | 1 | CX315 | G | Hap3 | |||
| JL199 | A:A | 1.00 | JL007 | T | Hap1 | JL211 | C:C | 1 | CX319 | G | Hap4 | |||
| JL200 | A:A | 1.00 | JL008 | T | Hap1 | JL222 | C:C | 1 | CX320 | G | Hap11 | |||
| JL205 | A:A | 1.00 | JL010 | T | Hap1 | JL223 | C:C | 1 | CX321 | G | Hap2 | |||
| JL212 | A:A | 1.00 | JL011 | T | Hap6 | JL225 | C:C | 1 | CX322 | G | Hap2 | |||
| JL213 | A:A | 1.00 | JL012 | T | Hap1 | JL226 | C:C | 1 | CX323 | G | Hap10 | |||
| JL214 | A:A | 1.00 | JL018 | T | Hap7 | JL227 | C:C | 1 | CX327 | G | Hap2 | |||
| JL215 | A:A | 1.00 | JL020 | T | Hap6 | JL228 | C:C | 1 | CX35 | G | Hap2 | |||
| JL216 | A:A | 1.00 | JL022 | T | Hap6 | JL229 | C:C | 1 | CX36 | G | Hap2 | |||
| JL217 | A:A | 1.00 | JL024 | T | Hap1 | JL230 | C:C | 1 | CX38 | G | Hap2 | |||
| JL219 | A:A | 1.00 | JL027 | T | Hap7 | JL231 | C:C | 1 | CX39 | G | Hap2 | |||
| JL220 | A:A | 1.00 | JL030 | T | Hap1 | JL232 | C:C | 1 | CX41 | G | Hap2 | |||
| JL221 | A:A | 1.00 | JL033 | T | Hap1 | JL233 | C:C | 1 | CX42 | G | Hap11 | |||
| JL224 | A:A | 1.00 | JL036 | T | Hap1 | JL234 | C:C | 1 | CX43 | G | Hap5 | |||
| JL243 | A:A | 1.00 | JL039 | T | Hap1 | JL235 | C:C | 1 | CX45 | G | Hap5 | |||
| JL245 | A:A | 1.00 | JL041 | T | Hap1 | JL236 | C:C | 1 | CX47 | G | Hap5 | |||
| JL246 | A:A | 1.00 | JL042 | T | Hap1 | JL237 | C:C | 1 | CX49 | G | Hap2 | |||
| JL254 | A:A | 1.00 | JL048 | T | Hap7 | JL240 | C:C | 1 | CX50 | G | Hap11 | |||
| JL256 | A:A | 1.00 | JL050 | T | Hap1 | JL247 | C:C | 1 | CX52 | G | Hap2 | |||
| JL258 | A:A | 1.00 | JL052 | T | Hap1 | JL248 | C:C | 1 | CX55 | G | Hap5 | |||
| JL259 | A:A | 1.00 | JL053 | T | Hap7 | JL249 | C:C | 1 | CX57 | G | Hap2 | |||
| JL260 | A:A | 1.00 | JL054 | T | Hap1 | JL250 | C:C | 1 | CX59 | G | Hap5 | |||
| JL264 | A:A | 1.00 | JL055 | T | Hap1 | JL251 | C:C | 1 | CX61 | G | Hap5 | |||
| JL267 | A:A | 1.00 | JL057 | T | Hap1 | JL252 | C:C | 1 | CX63 | G | Hap5 | |||
| JL274 | A:A | 1.00 | JL058 | T | Hap7 | JL253 | C:C | 1 | CX67 | G | Hap2 | |||
| JL277 | A:A | 1.00 | JL059 | T | Hap1 | JL261 | C:C | 1 | CX68 | G | Hap3 | |||
| JL278 | A:A | 1.00 | JL060 | T | Hap1 | JL262 | C:C | 1 | CX71 | G | Hap4 | |||
| JL279 | A:A | 1.00 | JL061 | T | Hap1 | JL266 | C:C | 1 | CX78 | G | Hap5 | |||
| JL287 | A:A | 1.00 | JL063 | T | Hap1 | JL268 | C:C | 1 | CX90 | G | Hap5 | |||
| JL288 | A:A | 1.00 | JL064 | T | Hap1 | JL269 | C:C | 1 | CX91 | G | Hap2 | |||
| JL289 | A:A | 1.00 | JL065 | T | Hap1 | JL273 | C:C | 1 | CX92 | G | Hap2 | |||
| JL292 | A:A | 1.00 | JL072 | T | Hap1 | JL276 | C:C | 1 | CX94 | G | Hap5 | |||
| JL296 | A:A | 1.00 | JL073 | T | Hap1 | JL280 | C:C | 1 | CX95 | G | Hap5 | |||
| JL300 | A:A | 1.00 | JL074 | T | Hap1 | JL282 | C:C | 1 | CX98 | G | Hap2 | |||
| JL301 | A:A | 1.00 | JL080 | T | Hap13 | JL285 | C:C | 1 | E2 | G | Hap2 | |||
| JL303 | A:A | 1.00 | JL083 | T | Hap1 | JL291 | C:C | 1 | E4 | G | Hap2 | |||
| JL304 | A:A | 1.00 | JL085 | T | Hap1 | JL293 | C:C | 1 | H101 | G | Hap5 | |||
| JL311 | A:A | 1.00 | JL087 | T | Hap1 | JL294 | C:C | 1 | H166 | G | Hap4 | |||
| JL312 | A:A | 1.00 | JL089 | T | Hap7 | JL295 | C:C | 1 | H601 | G | Hap2 | |||
| JL313 | A:A | 1.00 | JL091 | T | Hap1 | JL297 | C:C | 1 | H660 | G | Hap2 | |||
| JL316 | A:A | 1.00 | JL093 | T | Hap1 | JL298 | C:C | 1 | H663 | G | Hap2 | |||
| JL317 | A:A | 1.00 | JL094 | T | Hap7 | JL299 | C:C | 1 | H681 | G | Hap11 | |||
| JL318 | A:A | 1.00 | JL101 | T | Hap1 | JL314 | C:C | 1 | H750 | G | Hap2 | |||
| JL320 | A:A | 1.00 | JL103 | T | Hap1 | JL315 | C:C | 1 | JL004 | G | Hap2 | |||
| JL321 | A:A | 1.00 | JL104 | T | Hap1 | JL322 | C:C | 1 | JL005 | G | Hap2 | |||
| JL324 | A:A | 1.00 | JL105 | T | Hap1 | JL332 | C:C | 1 | JL009 | G | Hap2 | |||
| JL325 | A:A | 1.00 | JL107 | T | Hap1 | JL334 | C:C | 1 | JL013 | G | Hap3 | |||
| JL327 | A:A | 1.00 | JL109 | T | Hap1 | JL336 | C:C | 1 | JL014 | G | Hap5 | |||
| JL330 | A:A | 1.00 | JL110 | T | Hap1 | JL337 | C:C | 1 | JL015 | G | Hap2 | |||
| JL333 | A:A | 1.00 | JL111 | T | Hap7 | JL339 | C:C | 1 | JL016 | G | Hap4 | |||
| JL335 | A:A | 1.00 | JL114 | T | Hap7 | JL343 | C:C | 1 | JL017 | G | Hap2 | |||
| JL345 | A:A | 1.00 | JL115 | T | Hap1 | JL344 | C:C | 1 | JL019 | G | Hap2 | |||
| JL346 | A:A | 1.00 | JL116 | T | Hap1 | JL347 | C:C | 1 | JL021 | G | Hap12 | |||
| JL348 | A:A | 1.00 | JL120 | T | Hap1 | 369 | C:C | 1 | JL023 | G | Hap2 | |||
| 411 | A:A | 1.00 | JL121 | T | Hap1 | 390 | C:C | 1 | JL025 | G | Hap3 | |||
| 458 | A:A | 1.00 | JL128 | T | Hap1 | 401 | C:C | 1 | JL026 | G | Hap2 | |||
| C1124 | A:A | 1.00 | JL129 | T | Hap1 | 438 | C:C | 1 | JL028 | G | Hap5 | |||
| C1137 | A:A | 1.00 | JL130 | T | Hap1 | C40 | C:C | 1 | JL029 | G | Hap5 | |||
| C38 | A:A | 1.00 | JL131 | T | Hap1 | C6 | C:C | 1 | JL031 | G | Hap11 | |||
| CX101 | A:A | 1.00 | JL142 | T | Hap1 | C8 | C:C | 1 | JL032 | G | Hap11 | |||
| CX106 | A:A | 1.00 | JL143 | T | Hap8 | CX12 | C:C | 1 | JL034 | G | Hap2 | |||
| CX115 | A:A | 1.00 | JL146 | T | Hap1 | CX164 | C:C | 1 | JL035 | G | Hap2 | |||
| CX131 | A:A | 1.00 | JL148 | T | Hap1 | CX170 | C:C | 1 | JL037 | G | Hap11 | |||
| CX132 | A:A | 1.00 | JL153 | T | Hap1 | CX173 | C:C | 1 | JL038 | G | Hap5 | |||
| CX144 | A:A | 1.00 | JL154 | T | Hap1 | CX179 | C:C | 1 | JL040 | G | Hap5 | |||
| CX147 | A:A | 1.00 | JL155 | T | Hap7 | CX187 | C:C | 1 | JL043 | G | Hap5 | |||
| CX149 | A:A | 1.00 | JL156 | T | Hap6 | CX193 | C:C | 1 | JL044 | G | Hap5 | |||
| CX151 | A:A | 1.00 | JL157 | T | Hap1 | CX253 | C:C | 1 | JL045 | G | Hap2 | |||
| CX157 | A:A | 1.00 | JL162 | T | Hap1 | CX262 | C:C | 1 | JL046 | G | Hap2 | |||
| CX175 | A:A | 1.00 | JL164 | T | Hap1 | CX280 | C:C | 1 | JL047 | G | Hap11 | |||
| CX186 | A:A | 1.00 | JL165 | T | Hap1 | CX282 | C:C | 1 | JL049 | G | Hap4 | |||
| CX19 | A:A | 1.00 | JL171 | T | Hap1 | CX292 | C:C | 1 | JL051 | G | Hap5 | |||
| CX192 | A:A | 1.00 | JL172 | T | Hap1 | CX293 | C:C | 1 | JL056 | G | Hap4 | |||
| CX203 | A:A | 1.00 | JL173 | T | Hap6 | CX298 | C:C | 1 | JL062 | G | Hap5 | |||
| CX206 | A:A | 1.00 | JL176 | T | Hap1 | CX299 | C:C | 1 | JL066 | G | Hap5 | |||
| CX207 | A:A | 1.00 | JL178 | T | Hap1 | CX305 | C:C | 1 | JL067 | G | Hap5 | |||
| CX209 | A:A | 1.00 | JL180 | T | Hap7 | CX308 | C:C | 1 | JL068 | G | Hap2 | |||
| CX21 | A:A | 1.00 | JL183 | T | Hap7 | CX311 | C:C | 1 | JL069 | G | Hap5 | |||
| CX22 | A:A | 1.00 | JL184 | T | Hap1 | CX312 | C:C | 1 | JL070 | G | Hap5 | |||
| CX230 | A:A | 1.00 | JL185 | T | Hap1 | CX34 | C:C | 1 | JL071 | G | Hap5 | |||
| CX242 | A:A | 1.00 | JL186 | T | Hap1 | CX54 | C:C | 1 | JL075 | G | Hap5 | |||
| CX256 | A:A | 1.00 | JL190 | T | Hap1 | CX65 | C:C | 1 | JL076 | G | Hap5 | |||
| CX258 | A:A | 1.00 | JL191 | T | Hap1 | CX83 | C:C | 1 | JL077 | G | Hap5 | |||
| CX259 | A:A | 1.00 | JL192 | T | Hap6 | JL006 | C:C | 1 | JL078 | G | Hap3 | |||
| CX264 | A:A | 1.00 | JL194 | T | Hap1 | JL011 | C:C | 1 | JL079 | G | Hap11 | |||
| CX27 | A:A | 1.00 | JL195 | T | Hap7 | JL020 | C:C | 1 | JL081 | G | Hap5 | |||
| CX278 | A:A | 1.00 | JL199 | T | Hap6 | JL042 | C:C | 1 | JL082 | G | Hap5 | |||
| CX290 | A:A | 1.00 | JL200 | T | Hap1 | JL055 | C:C | 1 | JL084 | G | Hap5 | |||
| CX294 | A:A | 1.00 | JL205 | T | Hap1 | JL058 | C:C | 1 | JL086 | G | Hap2 | |||
| CX300 | A:A | 1.00 | JL206 | T | Hap6 | JL087 | C:C | 1 | JL088 | G | Hap5 | |||
| CX304 | A:A | 1.00 | JL207 | T | Hap1 | JL101 | C:C | 1 | JL090 | G | Hap2 | |||
| CX315 | A:A | 1.00 | JL209 | T | Hap1 | JL107 | C:C | 1 | JL092 | G | Hap4 | |||
| CX320 | A:A | 1.00 | JL212 | T | Hap1 | JL120 | C:C | 1 | JL095 | G | Hap11 | |||
| CX321 | A:A | 1.00 | JL213 | T | Hap1 | JL128 | C:C | 1 | JL096 | G | Hap3 | |||
| CX322 | A:A | 1.00 | JL214 | T | Hap6 | JL130 | C:C | 1 | JL097 | G | Hap5 | |||
| CX327 | A:A | 1.00 | JL215 | T | Hap1 | JL157 | C:C | 1 | JL098 | G | Hap2 | |||
| CX36 | A:A | 1.00 | JL216 | T | Hap6 | JL183 | C:C | 1 | JL099 | G | Hap5 | |||
| CX39 | A:A | 1.00 | JL217 | T | Hap1 | JL185 | C:C | 1 | JL100 | G | Hap2 | |||
| CX45 | A:A | 1.00 | JL218 | T | Hap1 | JL206 | C:C | 1 | JL102 | G | Hap11 | |||
| CX57 | A:A | 1.00 | JL219 | T | Hap1 | JL207 | C:C | 1 | JL106 | G | Hap3 | |||
| CX61 | A:A | 1.00 | JL220 | T | Hap6 | JL239 | C:C | 1 | JL108 | G | Hap2 | |||
| CX63 | A:A | 1.00 | JL221 | T | Hap16 | JL242 | C:C | 1 | JL112 | G | Hap2 | |||
| CX71 | A:A | 1.00 | JL224 | T | Hap1 | JL244 | C:C | 1 | JL113 | G | Hap2 | |||
| CX95 | A:A | 1.00 | JL239 | T | Hap7 | JL255 | C:C | 1 | JL117 | G | Hap3 | |||
| E2 | A:A | 1.00 | JL242 | T | Hap8 | JL283 | C:C | 1 | JL118 | G | Hap14 | |||
| E4 | A:A | 1.00 | JL243 | T | Hap1 | JL290 | C:C | 1 | JL119 | G | Hap5 | |||
| H166 | A:A | 1.00 | JL244 | T | Hap1 | JL305 | C:C | 1 | JL122 | G | Hap3 | |||
| JL004 | A:A | 1.00 | JL245 | T | Hap1 | JL323 | C:C | 1 | JL123 | G | Hap12 | |||
| JL023 | A:A | 1.00 | JL246 | T | Hap1 | JL331 | C:C | 1 | JL124 | G | Hap5 | |||
| JL025 | A:A | 1.00 | JL254 | T | Hap7 | JL125 | G | Hap3 | ||||||
| JL026 | A:A | 1.00 | JL255 | T | Hap1 | JL126 | G | Hap2 | ||||||
| JL028 | A:A | 1.00 | JL256 | T | Hap8 | JL127 | G | Hap3 | ||||||
| JL044 | A:A | 1.00 | JL258 | T | Hap1 | JL132 | G | Hap11 | ||||||
| JL049 | A:A | 1.00 | JL259 | T | Hap1 | JL133 | G | Hap2 | ||||||
| JL056 | A:A | 1.00 | JL260 | T | Hap1 | JL134 | G | Hap4 | ||||||
| JL086 | A:A | 1.00 | JL264 | T | Hap8 | JL135 | G | Hap5 | ||||||
| JL088 | A:A | 1.00 | JL267 | T | Hap1 | JL136 | G | Hap5 | ||||||
| JL090 | A:A | 1.00 | JL274 | T | Hap6 | JL137 | G | Hap3 | ||||||
| JL092 | A:A | 1.00 | JL277 | T | Hap1 | JL138 | G | Hap3 | ||||||
| JL100 | A:A | 1.00 | JL278 | T | Hap1 | JL139 | G | Hap5 | ||||||
| JL106 | A:A | 1.00 | JL279 | T | Hap1 | JL140 | G | Hap5 | ||||||
| JL108 | A:A | 1.00 | JL283 | T | Hap1 | JL141 | G | Hap2 | ||||||
| JL117 | A:A | 1.00 | JL287 | T | Hap1 | JL144 | G | Hap5 | ||||||
| JL118 | A:A | 1.00 | JL288 | T | Hap7 | JL145 | G | Hap5 | ||||||
| JL125 | A:A | 1.00 | JL289 | T | Hap7 | JL147 | G | Hap5 | ||||||
| JL127 | A:A | 1.00 | JL290 | T | Hap1 | JL149 | G | Hap5 | ||||||
| JL133 | A:A | 1.00 | JL292 | T | Hap1 | JL150 | G | Hap5 | ||||||
| JL134 | A:A | 1.00 | JL296 | T | Hap1 | JL151 | G | Hap5 | ||||||
| JL135 | A:A | 1.00 | JL300 | T | Hap6 | JL152 | G | Hap2 | ||||||
| JL147 | A:A | 1.00 | JL301 | T | Hap1 | JL158 | G | Hap2 | ||||||
| JL150 | A:A | 1.00 | JL303 | T | Hap8 | JL159 | G | Hap2 | ||||||
| JL158 | A:A | 1.00 | JL304 | T | Hap1 | JL160 | G | Hap2 | ||||||
| JL160 | A:A | 1.00 | JL305 | T | Hap1 | JL161 | G | Hap5 | ||||||
| JL163 | A:A | 1.00 | JL307 | T | Hap1 | JL163 | G | Hap2 | ||||||
| JL168 | A:A | 1.00 | JL311 | T | Hap8 | JL166 | G | Hap3 | ||||||
| JL169 | A:A | 1.00 | JL312 | T | Hap1 | JL167 | G | Hap4 | ||||||
| JL174 | A:A | 1.00 | JL313 | T | Hap1 | JL168 | G | Hap5 | ||||||
| JL177 | A:A | 1.00 | JL316 | T | Hap1 | JL169 | G | Hap2 | ||||||
| JL196 | A:A | 1.00 | JL317 | T | Hap7 | JL170 | G | Hap3 | ||||||
| JL204 | A:A | 1.00 | JL318 | T | Hap1 | JL174 | G | Hap2 | ||||||
| JL238 | A:A | 1.00 | JL320 | T | Hap6 | JL175 | G | Hap5 | ||||||
| JL241 | A:A | 1.00 | JL321 | T | Hap1 | JL177 | G | Hap5 | ||||||
| JL257 | A:A | 1.00 | JL323 | T | Hap1 | JL179 | G | Hap5 | ||||||
| JL263 | A:A | 1.00 | JL324 | T | Hap1 | JL181 | G | Hap5 | ||||||
| JL270 | A:A | 1.00 | JL325 | T | Hap1 | JL182 | G | Hap2 | ||||||
| JL271 | A:A | 1.00 | JL327 | T | Hap1 | JL187 | G | Hap5 | ||||||
| JL272 | A:A | 1.00 | JL330 | T | Hap1 | JL188 | G | Hap5 | ||||||
| JL275 | A:A | 1.00 | JL331 | T | Hap1 | JL189 | G | Hap11 | ||||||
| JL281 | A:A | 1.00 | JL333 | T | Hap6 | JL193 | G | Hap2 | ||||||
| JL284 | A:A | 1.00 | JL335 | T | Hap6 | JL196 | G | Hap5 | ||||||
| JL286 | A:A | 1.00 | JL345 | T | Hap1 | JL197 | G | Hap3 | ||||||
| JL302 | A:A | 1.00 | JL346 | T | Hap1 | JL198 | G | Hap15 | ||||||
| JL308 | A:A | 1.00 | JL348 | T | Hap1 | JL201 | G | Hap5 | ||||||
| JL310 | A:A | 1.00 | JL202 | G | Hap4 | |||||||||
| JL319 | A:A | 1.00 | JL203 | G | Hap5 | |||||||||
| JL326 | A:A | 1.00 | JL204 | G | Hap14 | |||||||||
| JL328 | A:A | 1.00 | JL208 | G | Hap5 | |||||||||
| JL329 | A:A | 1.00 | JL210 | G | Hap5 | |||||||||
| JL340 | A:A | 1.00 | JL211 | G | Hap5 | |||||||||
| JL341 | A:A | 1.00 | JL222 | G | Hap11 | |||||||||
| JL342 | A:A | 1.00 | JL223 | G | Hap5 | |||||||||
| JL349 | A:A | 1.00 | JL225 | G | Hap5 | |||||||||
| JL226 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL227 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL228 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL229 | G | Hap11 | ||||||||||||
| JL230 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL231 | G | Hap9 | ||||||||||||
| JL232 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL233 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL234 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL235 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL236 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL237 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL238 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL240 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL241 | G | Hap11 | ||||||||||||
| JL247 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL248 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL249 | G | Hap11 | ||||||||||||
| JL250 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL251 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL252 | G | Hap11 | ||||||||||||
| JL253 | G | Hap11 | ||||||||||||
| JL257 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL261 | G | Hap3 | ||||||||||||
| JL262 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL263 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL265 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL266 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL268 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL269 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL270 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL271 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL272 | G | Hap3 | ||||||||||||
| JL273 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL275 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL276 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL280 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL281 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL282 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL284 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL285 | G | Hap14 | ||||||||||||
| JL286 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL291 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL293 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL294 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL295 | G | Hap11 | ||||||||||||
| JL297 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL298 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL299 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL302 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL306 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL308 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL309 | G | Hap11 | ||||||||||||
| JL310 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL314 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL315 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL319 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL322 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL326 | G | Hap3 | ||||||||||||
| JL328 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL329 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL332 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL334 | G | Hap11 | ||||||||||||
| JL336 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL337 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL338 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL339 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL340 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL341 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL342 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL343 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL344 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL347 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL349 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL350 | G | Hap9 | ||||||||||||