| Gene | Accessionnumber | Functionalannotation | Reference | Controllingtrait | P-value | Haplotype | 688Coincidencerate | Sequence | ||||||
| GmFAD2-1B | Glyma.20G111000 | Catalyzes formation of linoleic acid from oleic acid and linolenic acid | Ustun et al., 2017; Combs et al., 2019 | Seed quality (oil content) | 0.01410 | Freq | Hap | Chr20__35315397 | oil | FAM | GTGCCAAAGGATTTTCGACCATC | |||
| 109 | Hap2 | G | LOW | 326/364 | 89.56% | HEX | GTGCCAAAGGATTTTCGACCATA | |||||||
| 40 | Hap3 | T | HIGH | 111/206 | 53.88% | R | GCTTACTCACAAAGCAGTCTTACACT | |||||||
| 下机 | 测序 | 下机 | 测序 | |||||||||||
| Sample Name | O101 | C | Sample Name | Chr20__35315397 | Hap | Sample Name | O101 | A | Sample Name | Chr20__35315397 | Hap | |||
| JL001 | C:C | 1 | 326.00 | 391 | G | Hap1 | JL031 | A:A | 1 | 111.00 | 369 | T | Hap57 | |
| JL002 | C:C | 1 | 364 | 401 | G | Hap1 | JL033 | A:A | 1 | 206 | 390 | T | Hap12 | |
| JL004 | C:C | 1 | 326/364 | 405 | G | Hap6 | JL034 | A:A | 1 | 111/206 | 432 | T | Hap37 | |
| JL005 | C:C | 1 | 407 | G | Hap7 | JL036 | A:A | 1 | C39 | T | Hap3 | |||
| JL006 | C:C | 1 | 411 | G | Hap6 | JL043 | A:A | 1 | C41 | T | Hap3 | |||
| JL007 | C:C | 1 | 413 | G | Hap6 | JL046 | A:A | 1 | C821 | T | Hap23 | |||
| JL008 | C:C | 1 | 438 | G | Hap1 | JL049 | A:A | 1 | C881 | T | Hap9 | |||
| JL010 | C:C | 1 | 442 | G | Hap1 | JL051 | A:A | 1 | CX109 | T | Hap47 | |||
| JL011 | C:C | 1 | 458 | G | Hap1 | JL060 | A:A | 1 | CX110 | T | Hap24 | |||
| JL012 | C:C | 1 | A2 | G | Hap1 | JL061 | A:A | 1 | CX112 | T | Hap148 | |||
| JL014 | C:C | 1 | A3 | G | Hap1 | JL067 | A:A | 1 | CX12 | T | Hap10 | |||
| JL015 | C:C | 1 | A4 | G | Hap170 | JL080 | A:A | 1 | CX129 | T | Hap150 | |||
| JL016 | C:C | 1 | B4 | G | Hap1 | JL081 | A:A | 1 | CX136 | T | Hap10 | |||
| JL017 | C:C | 1 | B5 | G | Hap5 | JL086 | A:A | 1 | CX145 | T | Hap154 | |||
| JL021 | C:C | 1 | B6 | G | Hap1 | JL083 | A:A | 1 | CX153 | T | Hap155 | |||
| JL022 | C:C | 1 | B8 | G | Hap1 | JL089 | A:A | 1 | CX155 | T | Hap3 | |||
| JL027 | C:C | 1 | C10 | G | Hap6 | JL090 | A:A | 1 | CX157 | T | Hap50 | |||
| JL030 | C:C | 1 | C1124 | G | Hap1 | JL091 | A:A | 1 | CX168 | T | Hap157 | |||
| JL024 | C:C | 1 | C1137 | G | Hap188 | JL092 | A:A | 1 | CX169 | T | Hap158 | |||
| JL025 | C:C | 1 | C12 | G | Hap1 | JL100 | A:A | 1 | CX180 | T | Hap160 | |||
| JL048 | C:C | 1 | C15 | G | Hap1 | JL101 | A:A | 1 | CX184 | T | Hap10 | |||
| JL050 | C:C | 1 | C2 | G | Hap31 | JL103 | A:A | 1 | CX186 | T | Hap25 | |||
| JL052 | C:C | 1 | C20 | G | Hap1 | JL104 | A:A | 1 | CX188 | T | Hap163 | |||
| JL053 | C:C | 1 | C22 | G | Hap67 | JL109 | A:A | 1 | CX192 | T | Hap164 | |||
| JL054 | C:C | 1 | C23 | G | Hap1 | JL110 | A:A | 1 | CX207 | T | Hap25 | |||
| JL058 | C:C | 1 | C24 | G | Hap4 | JL111 | A:A | 1 | CX21 | T | Hap52 | |||
| JL062 | C:C | 1 | C25 | G | Hap1 | JL116 | A:A | 1 | CX212 | T | Hap169 | |||
| JL063 | C:C | 1 | C26 | G | Hap2 | JL122 | A:A | 1 | CX213 | T | Hap3 | |||
| JL065 | C:C | 1 | C28 | G | Hap6 | JL125 | A:A | 1 | CX217 | T | Hap21 | |||
| JL068 | C:C | 1 | C30 | G | Hap7 | JL127 | A:A | 1 | CX219 | T | Hap172 | |||
| JL073 | C:C | 1 | C32 | G | Hap8 | JL129 | A:A | 1 | CX222 | T | Hap3 | |||
| JL075 | C:C | 1 | C36 | G | Hap1 | JL131 | A:A | 1 | CX228 | T | Hap23 | |||
| JL079 | C:C | 1 | C38 | G | Hap1 | JL139 | A:A | 1 | CX248 | T | Hap174 | |||
| JL085 | C:C | 1 | C4 | G | Hap44 | JL143 | A:A | 1 | CX254 | T | Hap9 | |||
| JL088 | C:C | 1 | C40 | G | Hap1 | JL146 | A:A | 1 | CX263 | T | Hap176 | |||
| JL084 | C:C | 1 | C42 | G | Hap1 | JL147 | A:A | 1 | CX264 | T | Hap177 | |||
| JL095 | C:C | 1 | C43 | G | Hap119 | JL150 | A:A | 1 | CX267 | T | Hap179 | |||
| JL096 | C:C | 1 | C44 | G | Hap130 | JL154 | A:A | 1 | CX271 | T | Hap181 | |||
| JL097 | C:C | 1 | C45 | G | Hap140 | JL155 | A:A | 1 | CX276 | T | Hap182 | |||
| JL099 | C:C | 1 | C6 | G | Hap4 | JL178 | A:A | 1 | CX277 | T | Hap183 | |||
| JL102 | C:C | 1 | C619 | G | Hap22 | JL179 | A:A | 1 | CX285 | T | Hap12 | |||
| JL106 | C:C | 1 | C7 | G | Hap1 | JL184 | A:A | 1 | CX288 | T | Hap190 | |||
| JL117 | C:C | 1 | C8 | G | Hap1 | JL182 | A:A | 1 | CX29 | T | Hap12 | |||
| JL119 | C:C | 1 | C884 | G | Hap5 | JL190 | A:A | 1 | CX291 | T | Hap191 | |||
| JL121 | C:C | 1 | C9 | G | Hap146 | JL194 | A:A | 1 | CX295 | T | Hap192 | |||
| JL123 | C:C | 1 | CX1 | G | Hap147 | JL195 | A:A | 1 | CX298 | T | Hap3 | |||
| JL124 | C:C | 1 | CX101 | G | Hap2 | JL199 | A:A | 1 | CX3 | T | Hap40 | |||
| JL126 | C:C | 1 | CX103 | G | Hap2 | JL203 | A:A | 1 | CX318 | T | Hap9 | |||
| JL134 | C:C | 1 | CX104 | G | Hap2 | JL208 | A:A | 1 | CX32 | T | Hap193 | |||
| JL135 | C:C | 1 | CX105 | G | Hap2 | JL212 | A:A | 1 | CX42 | T | Hap24 | |||
| JL136 | C:C | 1 | CX106 | G | Hap6 | JL213 | A:A | 1 | CX59 | T | Hap23 | |||
| JL137 | C:C | 1 | CX107 | G | Hap7 | JL215 | A:A | 1 | CX76 | T | Hap59 | |||
| JL132 | C:C | 1 | CX108 | G | Hap1 | JL219 | A:A | 1 | CX91 | T | Hap3 | |||
| JL133 | C:C | 1 | CX11 | G | Hap1 | JL222 | A:A | 1 | CX96 | T | Hap3 | |||
| JL138 | C:C | 1 | CX113 | G | Hap18 | JL225 | A:A | 1 | E1 | T | Hap10 | |||
| JL141 | C:C | 1 | CX114 | G | Hap2 | JL226 | A:A | 1 | H166 | T | Hap62 | |||
| JL144 | C:C | 1 | CX115 | G | Hap1 | JL253 | A:A | 1 | H542 | T | Hap3 | |||
| JL145 | C:C | 1 | CX116 | G | Hap48 | JL256 | A:A | 1 | H663 | T | Hap64 | |||
| JL148 | C:C | 1 | CX117 | G | Hap1 | JL261 | A:A | 1 | H681 | T | Hap65 | |||
| JL149 | C:C | 1 | CX118 | G | Hap18 | JL263 | A:A | 1 | JL026 | T | Hap9 | |||
| JL151 | C:C | 1 | CX119 | G | Hap2 | JL264 | A:A | 1 | JL028 | T | Hap76 | |||
| JL152 | C:C | 1 | CX120 | G | Hap22 | JL267 | A:A | 1 | JL031 | T | Hap27 | |||
| JL153 | C:C | 1 | CX121 | G | Hap29 | JL269 | A:A | 1 | JL033 | T | Hap3 | |||
| JL159 | C:C | 1 | CX122 | G | Hap1 | JL271 | A:A | 1 | JL034 | T | Hap78 | |||
| JL160 | C:C | 1 | CX123 | G | Hap2 | JL273 | A:A | 1 | JL035 | T | Hap32 | |||
| JL161 | C:C | 1 | CX124 | G | Hap2 | JL281 | A:A | 1 | JL036 | T | Hap3 | |||
| JL164 | C:C | 1 | CX126 | G | Hap2 | JL288 | A:A | 1 | JL037 | T | Hap79 | |||
| JL166 | C:C | 1 | CX127 | G | Hap1 | JL289 | A:A | 1 | JL039 | T | Hap3 | |||
| JL167 | C:C | 1 | CX128 | G | Hap149 | JL294 | A:A | 1 | JL043 | T | Hap81 | |||
| JL168 | C:C | 1 | CX13 | G | Hap13 | JL301 | A:A | 1 | JL044 | T | Hap9 | |||
| JL170 | C:C | 1 | CX130 | G | Hap1 | JL302 | A:A | 1 | JL046 | T | Hap24 | |||
| JL171 | C:C | 1 | CX131 | G | Hap2 | JL303 | A:A | 1 | JL049 | T | Hap12 | |||
| JL172 | C:C | 1 | CX132 | G | Hap22 | JL309 | A:A | 1 | JL051 | T | Hap52 | |||
| JL173 | C:C | 1 | CX133 | G | Hap4 | JL332 | A:A | 1 | JL055 | T | Hap23 | |||
| JL175 | C:C | 1 | CX134 | G | Hap5 | JL334 | A:A | 1 | JL059 | T | Hap3 | |||
| JL177 | C:C | 1 | CX135 | G | Hap6 | JL330 | A:A | 1 | JL060 | T | Hap37 | |||
| JL180 | C:C | 1 | CX137 | G | Hap1 | JL331 | A:A | 1 | JL061 | T | Hap3 | |||
| JL183 | C:C | 1 | CX138 | G | Hap49 | JL336 | A:A | 1 | JL066 | T | Hap12 | |||
| JL181 | C:C | 1 | CX139 | G | Hap151 | JL337 | A:A | 1 | JL067 | T | Hap9 | |||
| JL187 | C:C | 1 | CX14 | G | Hap152 | JL348 | A:A | 1 | JL069 | T | Hap3 | |||
| JL188 | C:C | 1 | CX140 | G | Hap7 | C881 | A:A | 1 | JL072 | T | Hap3 | |||
| JL193 | C:C | 1 | CX141 | G | Hap153 | CX12 | A:A | 1 | JL080 | T | Hap86 | |||
| JL197 | C:C | 1 | CX142 | G | Hap7 | CX29 | A:A | 1 | JL081 | T | Hap25 | |||
| JL198 | C:C | 1 | CX143 | G | Hap31 | CX32 | A:A | 1 | JL083 | T | Hap88 | |||
| JL201 | C:C | 1 | CX144 | G | Hap34 | CX42 | A:A | 1 | JL086 | T | Hap89 | |||
| JL204 | C:C | 1 | CX146 | G | Hap19 | CX76 | A:A | 1 | JL089 | T | Hap3 | |||
| JL207 | C:C | 1 | CX147 | G | Hap2 | CX91 | A:A | 1 | JL090 | T | Hap90 | |||
| JL209 | C:C | 1 | CX148 | G | Hap14 | CX96 | A:A | 1 | JL091 | T | Hap3 | |||
| JL214 | C:C | 1 | CX149 | G | Hap35 | CX110 | A:A | 1 | JL092 | T | Hap3 | |||
| JL216 | C:C | 1 | CX150 | G | Hap49 | CX136 | A:A | 1 | JL093 | T | Hap24 | |||
| JL217 | C:C | 1 | CX151 | G | Hap5 | CX145 | A:A | 1 | JL100 | T | Hap47 | |||
| JL218 | C:C | 1 | CX152 | G | Hap8 | CX169 | A:A | 1 | JL101 | T | Hap25 | |||
| JL221 | C:C | 1 | CX154 | G | Hap36 | CX180 | A:A | 1 | JL103 | T | Hap21 | |||
| JL227 | C:C | 1 | CX156 | G | Hap4 | CX192 | A:A | 1 | JL104 | T | Hap3 | |||
| JL228 | C:C | 1 | CX158 | G | Hap6 | CX217 | A:A | 1 | JL105 | T | Hap3 | |||
| JL233 | C:C | 1 | CX159 | G | Hap156 | CX228 | A:A | 1 | JL109 | T | Hap3 | |||
| JL234 | C:C | 1 | CX160 | G | Hap20 | CX267 | A:A | 1 | JL110 | T | Hap93 | |||
| JL235 | C:C | 1 | CX161 | G | Hap4 | CX271 | A:A | 1 | JL111 | T | Hap3 | |||
| JL236 | C:C | 1 | CX162 | G | Hap1 | CX277 | A:A | 1 | JL116 | T | Hap10 | |||
| JL232 | C:C | 1 | CX163 | G | Hap1 | CX285 | A:A | 1 | JL120 | T | Hap94 | |||
| JL238 | C:C | 1 | CX164 | G | Hap1 | CX3 | A:A | 1 | JL122 | T | Hap95 | |||
| JL240 | C:C | 1 | CX165 | G | Hap6 | CX207 | A:A | 1 | JL125 | T | Hap10 | |||
| JL242 | C:C | 1 | CX167 | G | Hap13 | CX213 | A:A | 1 | JL127 | T | Hap40 | |||
| JL243 | C:C | 1 | CX17 | G | Hap8 | CX291 | A:A | 1 | JL128 | T | Hap98 | |||
| JL245 | C:C | 1 | CX170 | G | Hap1 | JL037 | A:A | 1 | JL129 | T | Hap3 | |||
| JL246 | C:C | 1 | CX171 | G | Hap14 | JL066 | A:A | 1 | JL130 | T | Hap43 | |||
| JL247 | C:C | 1 | CX172 | G | Hap2 | JL072 | A:A | 1 | JL131 | T | Hap10 | |||
| JL248 | C:C | 1 | CX173 | G | Hap1 | JL251 | A:A | 1 | JL139 | T | Hap12 | |||
| JL249 | C:C | 1 | CX174 | G | Hap30 | JL311 | A:A | 1 | JL143 | T | Hap102 | |||
| JL250 | C:C | 1 | CX175 | G | Hap2 | H542 | A:A | 1 | JL146 | T | Hap21 | |||
| JL254 | C:C | 1 | CX176 | G | Hap29 | H681 | A:A | 1 | JL147 | T | Hap104 | |||
| JL255 | C:C | 1 | CX177 | G | Hap2 | JL009 | A:A | 1 | JL150 | T | Hap24 | |||
| JL258 | C:C | 1 | CX178 | G | Hap6 | JL018 | A:A | 1 | JL154 | T | Hap106 | |||
| JL259 | C:C | 1 | CX179 | G | Hap15 | JL019 | A:A | 1 | JL155 | T | Hap107 | |||
| JL260 | C:C | 1 | CX18 | G | Hap159 | JL020 | A:A | 1 | JL157 | T | Hap3 | |||
| JL268 | C:C | 1 | CX181 | G | Hap11 | JL023 | A:A | 1 | JL174 | T | Hap111 | |||
| JL270 | C:C | 1 | CX182 | G | Hap161 | JL029 | A:A | 1 | JL178 | T | Hap33 | |||
| JL272 | C:C | 1 | CX183 | G | Hap162 | JL032 | A:A | 1 | JL179 | T | Hap32 | |||
| JL274 | C:C | 1 | CX185 | G | Hap2 | JL042 | A:A | 1 | JL182 | T | Hap3 | |||
| JL277 | C:C | 1 | CX187 | G | Hap2 | JL045 | A:A | 1 | JL184 | T | Hap23 | |||
| JL278 | C:C | 1 | CX189 | G | Hap4 | JL047 | A:A | 1 | JL185 | T | Hap43 | |||
| JL279 | C:C | 1 | CX19 | G | Hap1 | JL056 | A:A | 1 | JL190 | T | Hap25 | |||
| JL282 | C:C | 1 | CX190 | G | Hap2 | JL057 | A:A | 1 | JL191 | T | Hap33 | |||
| JL285 | C:C | 1 | CX191 | G | Hap2 | JL064 | A:A | 1 | JL194 | T | Hap37 | |||
| JL280 | C:C | 1 | CX193 | G | Hap165 | JL070 | A:A | 1 | JL195 | T | Hap21 | |||
| JL286 | C:C | 1 | CX194 | G | Hap2 | JL082 | A:A | 1 | JL199 | T | Hap9 | |||
| JL287 | C:C | 1 | CX195 | G | Hap166 | JL087 | A:A | 1 | JL202 | T | Hap113 | |||
| JL290 | C:C | 1 | CX196 | G | Hap2 | JL098 | A:A | 1 | JL203 | T | Hap27 | |||
| JL292 | C:C | 1 | CX197 | G | Hap2 | JL108 | A:A | 1 | JL206 | T | Hap115 | |||
| JL293 | C:C | 1 | CX198 | G | Hap2 | JL112 | A:A | 1 | JL208 | T | Hap9 | |||
| JL295 | C:C | 1 | CX199 | G | Hap1 | JL114 | A:A | 1 | JL210 | T | Hap3 | |||
| JL296 | C:C | 1 | CX2 | G | Hap2 | JL115 | A:A | 1 | JL212 | T | Hap21 | |||
| JL297 | C:C | 1 | CX20 | G | Hap15 | JL118 | A:A | 1 | JL213 | T | Hap3 | |||
| JL298 | C:C | 1 | CX200 | G | Hap2 | JL140 | A:A | 1 | JL215 | T | Hap116 | |||
| JL299 | C:C | 1 | CX201 | G | Hap51 | JL142 | A:A | 1 | JL219 | T | Hap3 | |||
| JL304 | C:C | 1 | CX202 | G | Hap2 | JL156 | A:A | 1 | JL222 | T | Hap3 | |||
| JL312 | C:C | 1 | CX203 | G | Hap35 | JL158 | A:A | 1 | JL225 | T | Hap3 | |||
| JL315 | C:C | 1 | CX204 | G | Hap2 | JL163 | A:A | 1 | JL226 | T | Hap10 | |||
| JL316 | C:C | 1 | CX205 | G | Hap38 | JL165 | A:A | 1 | JL239 | T | Hap120 | |||
| JL317 | C:C | 1 | CX206 | G | Hap2 | JL169 | A:A | 1 | JL251 | T | Hap3 | |||
| JL318 | C:C | 1 | CX209 | G | Hap167 | JL186 | A:A | 1 | JL253 | T | Hap33 | |||
| JL319 | C:C | 1 | CX210 | G | Hap168 | JL196 | A:A | 1 | JL256 | T | Hap123 | |||
| JL320 | C:C | 1 | CX211 | G | Hap53 | JL200 | A:A | 1 | JL261 | T | Hap21 | |||
| JL321 | C:C | 1 | CX214 | G | Hap39 | JL205 | A:A | 1 | JL263 | T | Hap3 | |||
| JL322 | C:C | 1 | CX215 | G | Hap171 | JL211 | A:A | 1 | JL264 | T | Hap128 | |||
| JL324 | C:C | 1 | CX216 | G | Hap8 | JL220 | A:A | 1 | JL265 | T | Hap3 | |||
| JL325 | C:C | 1 | CX218 | G | Hap2 | JL223 | A:A | 1 | JL267 | T | Hap50 | |||
| JL326 | C:C | 1 | CX22 | G | Hap173 | JL224 | A:A | 1 | JL269 | T | Hap27 | |||
| JL327 | C:C | 1 | CX220 | G | Hap26 | JL230 | A:A | 1 | JL271 | T | Hap131 | |||
| JL328 | C:C | 1 | CX221 | G | Hap2 | JL231 | A:A | 1 | JL273 | T | Hap3 | |||
| JL333 | C:C | 1 | CX225 | G | Hap1 | JL237 | A:A | 1 | JL281 | T | Hap3 | |||
| JL335 | C:C | 1 | CX230 | G | Hap6 | JL241 | A:A | 1 | JL283 | T | Hap3 | |||
| JL340 | C:C | 1 | CX235 | G | Hap1 | JL244 | A:A | 1 | JL288 | T | Hap12 | |||
| JL341 | C:C | 1 | CX24 | G | Hap15 | JL252 | A:A | 1 | JL289 | T | Hap32 | |||
| JL343 | C:C | 1 | CX242 | G | Hap5 | JL257 | A:A | 1 | JL291 | T | Hap10 | |||
| JL344 | C:C | 1 | CX243 | G | Hap4 | JL262 | A:A | 1 | JL294 | T | Hap40 | |||
| JL345 | C:C | 1 | CX246 | G | Hap2 | JL266 | A:A | 1 | JL301 | T | Hap46 | |||
| JL346 | C:C | 1 | CX247 | G | Hap4 | JL275 | A:A | 1 | JL302 | T | Hap133 | |||
| C10 | C:C | 1 | CX249 | G | Hap20 | JL276 | A:A | 1 | JL303 | T | Hap27 | |||
| C4 | C:C | 1 | CX250 | G | Hap1 | JL284 | A:A | 1 | JL305 | T | Hap134 | |||
| C6 | C:C | 1 | CX251 | G | Hap5 | JL300 | A:A | 1 | JL309 | T | Hap135 | |||
| C7 | C:C | 1 | CX253 | G | Hap19 | JL308 | A:A | 1 | JL311 | T | Hap9 | |||
| C8 | C:C | 1 | CX256 | G | Hap31 | JL310 | A:A | 1 | JL330 | T | Hap137 | |||
| C9 | C:C | 1 | CX257 | G | Hap6 | JL313 | A:A | 1 | JL331 | T | Hap3 | |||
| C22 | C:C | 1 | CX258 | G | Hap175 | JL323 | A:A | 1 | JL332 | T | Hap138 | |||
| C25 | C:C | 1 | CX259 | G | Hap8 | JL329 | A:A | 1 | JL334 | T | Hap3 | |||
| C26 | C:C | 1 | CX26 | G | Hap4 | JL339 | A:A | 1 | JL336 | T | Hap46 | |||
| C36 | C:C | 1 | CX261 | G | Hap8 | JL342 | A:A | 1 | JL337 | T | Hap3 | |||
| C40 | C:C | 1 | CX262 | G | Hap2 | C2 | A:A | 1 | JL347 | T | Hap142 | |||
| C42 | C:C | 1 | CX265 | G | Hap178 | C38 | A:A | 1 | JL348 | T | Hap143 | |||
| C43 | C:C | 1 | CX268 | G | Hap4 | CX27 | A:A | 1 | JL349 | T | Hap144 | |||
| C1124 | C:C | 1 | CX269 | G | Hap180 | CX28 | A:A | 1 | ||||||
| C1137 | C:C | 1 | CX27 | G | Hap2 | CX45 | A:A | 1 | ||||||
| CX1 | C:C | 1 | CX270 | G | Hap2 | CX80 | A:A | 1 | ||||||
| CX5 | C:C | 1 | CX272 | G | Hap2 | CX101 | A:A | 1 | ||||||
| CX6 | C:C | 1 | CX273 | G | Hap15 | CX103 | A:A | 1 | ||||||
| CX8 | C:C | 1 | CX274 | G | Hap6 | CX127 | A:A | 1 | ||||||
| CX13 | C:C | 1 | CX275 | G | Hap1 | CX130 | A:A | 1 | ||||||
| CX17 | C:C | 1 | CX278 | G | Hap2 | CX135 | A:A | 1 | ||||||
| CX18 | C:C | 1 | CX279 | G | Hap184 | CX144 | A:A | 1 | ||||||
| CX19 | C:C | 1 | CX28 | G | Hap185 | CX154 | A:A | 1 | ||||||
| CX22 | C:C | 1 | CX280 | G | Hap186 | CX158 | A:A | 1 | ||||||
| CX24 | C:C | 1 | CX281 | G | Hap30 | CX159 | A:A | 1 | ||||||
| CX26 | C:C | 1 | CX282 | G | Hap187 | CX161 | A:A | 1 | ||||||
| CX20 | C:C | 1 | CX283 | G | Hap189 | CX179 | A:A | 1 | ||||||
| CX30 | C:C | 1 | CX284 | G | Hap2 | CX203 | A:A | 1 | ||||||
| CX34 | C:C | 1 | CX287 | G | Hap30 | CX209 | A:A | 1 | ||||||
| CX35 | C:C | 1 | CX290 | G | Hap2 | CX211 | A:A | 1 | ||||||
| CX38 | C:C | 1 | CX292 | G | Hap36 | CX220 | A:A | 1 | ||||||
| CX39 | C:C | 1 | CX293 | G | Hap1 | CX258 | A:A | 1 | ||||||
| CX47 | C:C | 1 | CX294 | G | Hap4 | CX262 | A:A | 1 | ||||||
| CX48 | C:C | 1 | CX296 | G | Hap1 | CX259 | A:A | 1 | ||||||
| CX49 | C:C | 1 | CX299 | G | Hap1 | CX269 | A:A | 1 | ||||||
| CX50 | C:C | 1 | CX30 | G | Hap2 | CX278 | A:A | 1 | ||||||
| CX53 | C:C | 1 | CX300 | G | Hap1 | CX290 | A:A | 1 | ||||||
| CX54 | C:C | 1 | CX301 | G | Hap7 | CX294 | A:A | 1 | ||||||
| CX57 | C:C | 1 | CX302 | G | Hap7 | CX299 | A:A | 1 | ||||||
| CX63 | C:C | 1 | CX303 | G | Hap1 | CX307 | A:A | 1 | ||||||
| CX64 | C:C | 1 | CX304 | G | Hap20 | CX308 | A:A | 1 | ||||||
| CX65 | C:C | 1 | CX305 | G | Hap14 | CX320 | A:A | 1 | ||||||
| CX66 | C:C | 1 | CX306 | G | Hap5 | CX242 | A:A | 1 | ||||||
| CX68 | C:C | 1 | CX307 | G | Hap5 | JL003 | A:A | 1 | ||||||
| CX71 | C:C | 1 | CX308 | G | Hap13 | 405 | A:A | 1 | ||||||
| CX74 | C:C | 1 | CX309 | G | Hap48 | 411 | A:A | 1 | ||||||
| CX78 | C:C | 1 | CX31 | G | Hap1 | 413 | A:A | 1 | ||||||
| CX84 | C:C | 1 | CX310 | G | Hap5 | 401 | A:A | 1 | ||||||
| CX90 | C:C | 1 | CX311 | G | Hap54 | |||||||||
| CX92 | C:C | 1 | CX312 | G | Hap6 | |||||||||
| CX93 | C:C | 1 | CX313 | G | Hap34 | |||||||||
| CX94 | C:C | 1 | CX314 | G | Hap26 | |||||||||
| CX95 | C:C | 1 | CX315 | G | Hap15 | |||||||||
| CX104 | C:C | 1 | CX316 | G | Hap8 | |||||||||
| CX108 | C:C | 1 | CX317 | G | Hap29 | |||||||||
| CX113 | C:C | 1 | CX319 | G | Hap38 | |||||||||
| CX115 | C:C | 1 | CX320 | G | Hap34 | |||||||||
| CX105 | C:C | 1 | CX321 | G | Hap1 | |||||||||
| CX106 | C:C | 1 | CX322 | G | Hap55 | |||||||||
| CX119 | C:C | 1 | CX323 | G | Hap194 | |||||||||
| CX123 | C:C | 1 | CX324 | G | Hap1 | |||||||||
| CX124 | C:C | 1 | CX325 | G | Hap1 | |||||||||
| CX131 | C:C | 1 | CX326 | G | Hap15 | |||||||||
| CX132 | C:C | 1 | CX327 | G | Hap1 | |||||||||
| CX134 | C:C | 1 | CX328 | G | Hap1 | |||||||||
| CX137 | C:C | 1 | CX329 | G | Hap7 | |||||||||
| CX138 | C:C | 1 | CX33 | G | Hap56 | |||||||||
| CX139 | C:C | 1 | CX34 | G | Hap4 | |||||||||
| CX140 | C:C | 1 | CX35 | G | Hap6 | |||||||||
| CX141 | C:C | 1 | CX36 | G | Hap56 | |||||||||
| CX142 | C:C | 1 | CX38 | G | Hap18 | |||||||||
| CX143 | C:C | 1 | CX39 | G | Hap5 | |||||||||
| CX146 | C:C | 1 | CX4 | G | Hap1 | |||||||||
| CX147 | C:C | 1 | CX41 | G | Hap1 | |||||||||
| CX148 | C:C | 1 | CX43 | G | Hap2 | |||||||||
| CX149 | C:C | 1 | CX44 | G | Hap26 | |||||||||
| CX150 | C:C | 1 | CX45 | G | Hap2 | |||||||||
| CX151 | C:C | 1 | CX47 | G | Hap1 | |||||||||
| CX152 | C:C | 1 | CX48 | G | Hap1 | |||||||||
| CX156 | C:C | 1 | CX49 | G | Hap1 | |||||||||
| CX160 | C:C | 1 | CX5 | G | Hap38 | |||||||||
| CX162 | C:C | 1 | CX50 | G | Hap2 | |||||||||
| CX163 | C:C | 1 | CX52 | G | Hap20 | |||||||||
| CX164 | C:C | 1 | CX53 | G | Hap1 | |||||||||
| CX170 | C:C | 1 | CX54 | G | Hap19 | |||||||||
| CX171 | C:C | 1 | CX55 | G | Hap1 | |||||||||
| CX175 | C:C | 1 | CX57 | G | Hap30 | |||||||||
| CX178 | C:C | 1 | CX6 | G | Hap11 | |||||||||
| CX172 | C:C | 1 | CX61 | G | Hap2 | |||||||||
| CX173 | C:C | 1 | CX63 | G | Hap1 | |||||||||
| CX181 | C:C | 1 | CX64 | G | Hap4 | |||||||||
| CX183 | C:C | 1 | CX65 | G | Hap58 | |||||||||
| CX185 | C:C | 1 | CX66 | G | Hap1 | |||||||||
| CX187 | C:C | 1 | CX67 | G | Hap22 | |||||||||
| CX193 | C:C | 1 | CX68 | G | Hap1 | |||||||||
| CX194 | C:C | 1 | CX71 | G | Hap1 | |||||||||
| CX196 | C:C | 1 | CX74 | G | Hap18 | |||||||||
| CX197 | C:C | 1 | CX78 | G | Hap2 | |||||||||
| CX198 | C:C | 1 | CX8 | G | Hap1 | |||||||||
| CX199 | C:C | 1 | CX80 | G | Hap2 | |||||||||
| CX201 | C:C | 1 | CX83 | G | Hap60 | |||||||||
| CX202 | C:C | 1 | CX84 | G | Hap20 | |||||||||
| CX204 | C:C | 1 | CX9 | G | Hap4 | |||||||||
| CX205 | C:C | 1 | CX90 | G | Hap2 | |||||||||
| CX215 | C:C | 1 | CX92 | G | Hap1 | |||||||||
| CX218 | C:C | 1 | CX93 | G | Hap61 | |||||||||
| CX221 | C:C | 1 | CX94 | G | Hap2 | |||||||||
| CX225 | C:C | 1 | CX95 | G | Hap2 | |||||||||
| CX230 | C:C | 1 | CX98 | G | Hap22 | |||||||||
| CX243 | C:C | 1 | E2 | G | Hap1 | |||||||||
| CX246 | C:C | 1 | E4 | G | Hap14 | |||||||||
| CX247 | C:C | 1 | F6 | G | Hap7 | |||||||||
| CX249 | C:C | 1 | H101 | G | Hap2 | |||||||||
| CX250 | C:C | 1 | H335 | G | Hap63 | |||||||||
| CX253 | C:C | 1 | H450 | G | Hap41 | |||||||||
| CX256 | C:C | 1 | H601 | G | Hap54 | |||||||||
| CX257 | C:C | 1 | H660 | G | Hap13 | |||||||||
| CX268 | C:C | 1 | H726 | G | Hap66 | |||||||||
| CX261 | C:C | 1 | H750 | G | Hap5 | |||||||||
| CX272 | C:C | 1 | H751 | G | Hap1 | |||||||||
| CX273 | C:C | 1 | H760 | G | Hap68 | |||||||||
| CX274 | C:C | 1 | JL001 | G | Hap8 | |||||||||
| CX275 | C:C | 1 | JL002 | G | Hap6 | |||||||||
| CX280 | C:C | 1 | JL003 | G | Hap1 | |||||||||
| CX281 | C:C | 1 | JL004 | G | Hap1 | |||||||||
| CX282 | C:C | 1 | JL005 | G | Hap7 | |||||||||
| CX283 | C:C | 1 | JL006 | G | Hap1 | |||||||||
| CX287 | C:C | 1 | JL007 | G | Hap1 | |||||||||
| CX292 | C:C | 1 | JL008 | G | Hap69 | |||||||||
| CX293 | C:C | 1 | JL009 | G | Hap1 | |||||||||
| CX300 | C:C | 1 | JL010 | G | Hap7 | |||||||||
| CX305 | C:C | 1 | JL011 | G | Hap70 | |||||||||
| CX309 | C:C | 1 | JL012 | G | Hap29 | |||||||||
| CX311 | C:C | 1 | JL013 | G | Hap1 | |||||||||
| CX312 | C:C | 1 | JL014 | G | Hap5 | |||||||||
| CX313 | C:C | 1 | JL015 | G | Hap55 | |||||||||
| CX314 | C:C | 1 | JL016 | G | Hap6 | |||||||||
| CX315 | C:C | 1 | JL017 | G | Hap5 | |||||||||
| CX316 | C:C | 1 | JL018 | G | Hap71 | |||||||||
| CX317 | C:C | 1 | JL019 | G | Hap11 | |||||||||
| CX319 | C:C | 1 | JL020 | G | Hap7 | |||||||||
| CX322 | C:C | 1 | JL021 | G | Hap11 | |||||||||
| CX328 | C:C | 1 | JL022 | G | Hap20 | |||||||||
| CX4 | C:C | 1 | JL023 | G | Hap72 | |||||||||
| CX206 | C:C | 1 | JL024 | G | Hap73 | |||||||||
| CX304 | C:C | 1 | JL025 | G | Hap74 | |||||||||
| CX321 | C:C | 1 | JL027 | G | Hap75 | |||||||||
| CX323 | C:C | 1 | JL029 | G | Hap77 | |||||||||
| CX326 | C:C | 1 | JL030 | G | Hap1 | |||||||||
| CX327 | C:C | 1 | JL032 | G | Hap35 | |||||||||
| JL038 | C:C | 1 | JL038 | G | Hap42 | |||||||||
| JL041 | C:C | 1 | JL040 | G | Hap80 | |||||||||
| JL071 | C:C | 1 | JL041 | G | Hap1 | |||||||||
| JL113 | C:C | 1 | JL042 | G | Hap1 | |||||||||
| JL162 | C:C | 1 | JL045 | G | Hap16 | |||||||||
| JL192 | C:C | 1 | JL047 | G | Hap2 | |||||||||
| JL229 | C:C | 1 | JL048 | G | Hap1 | |||||||||
| JL314 | C:C | 1 | JL050 | G | Hap19 | |||||||||
| 438 | C:C | 1 | JL052 | G | Hap2 | |||||||||
| 458 | C:C | 1 | JL053 | G | Hap2 | |||||||||
| A3 | C:C | 1 | JL054 | G | Hap16 | |||||||||
| B4 | C:C | 1 | JL056 | G | Hap82 | |||||||||
| E2 | C:C | 1 | JL057 | G | Hap42 | |||||||||
| E4 | C:C | 1 | JL058 | G | Hap4 | |||||||||
| H660 | C:C | 1 | JL062 | G | Hap14 | |||||||||
| H750 | C:C | 1 | JL063 | G | Hap14 | |||||||||
| H751 | C:C | 1 | JL064 | G | Hap83 | |||||||||
| H760 | C:C | 1 | JL065 | G | Hap1 | |||||||||
| JL028 | C:C | 1 | JL068 | G | Hap17 | |||||||||
| JL044 | C:C | 1 | JL070 | G | Hap84 | |||||||||
| JL055 | C:C | 1 | JL071 | G | Hap4 | |||||||||
| JL059 | C:C | 1 | JL073 | G | Hap28 | |||||||||
| JL069 | C:C | 1 | JL074 | G | Hap1 | |||||||||
| JL105 | C:C | 1 | JL075 | G | Hap2 | |||||||||
| JL120 | C:C | 1 | JL076 | G | Hap2 | |||||||||
| JL128 | C:C | 1 | JL077 | G | Hap85 | |||||||||
| JL130 | C:C | 1 | JL078 | G | Hap7 | |||||||||
| JL157 | C:C | 1 | JL079 | G | Hap11 | |||||||||
| JL174 | C:C | 1 | JL082 | G | Hap87 | |||||||||
| JL185 | C:C | 1 | JL084 | G | Hap1 | |||||||||
| JL191 | C:C | 1 | JL085 | G | Hap2 | |||||||||
| JL202 | C:C | 1 | JL087 | G | Hap1 | |||||||||
| JL206 | C:C | 1 | JL088 | G | Hap7 | |||||||||
| JL210 | C:C | 1 | JL094 | G | Hap91 | |||||||||
| JL239 | C:C | 1 | JL095 | G | Hap11 | |||||||||
| JL283 | C:C | 1 | JL096 | G | Hap2 | |||||||||
| JL291 | C:C | 1 | JL097 | G | Hap1 | |||||||||
| JL347 | C:C | 1 | JL098 | G | Hap18 | |||||||||
| CX21 | C:C | 1 | JL099 | G | Hap2 | |||||||||
| CX153 | C:C | 1 | JL102 | G | Hap39 | |||||||||
| CX155 | C:C | 1 | JL106 | G | Hap92 | |||||||||
| CX157 | C:C | 1 | JL107 | G | Hap2 | |||||||||
| CX168 | C:C | 1 | JL108 | G | Hap2 | |||||||||
| CX184 | C:C | 1 | JL112 | G | Hap11 | |||||||||
| CX186 | C:C | 1 | JL113 | G | Hap2 | |||||||||
| CX248 | C:C | 1 | JL114 | G | Hap11 | |||||||||
| CX264 | C:C | 1 | JL115 | G | Hap1 | |||||||||
| CX276 | C:C | 1 | JL117 | G | Hap19 | |||||||||
| CX298 | C:C | 1 | JL118 | G | Hap13 | |||||||||
| CX318 | C:C | 1 | JL119 | G | Hap5 | |||||||||
| JL026 | C:C | 1 | JL121 | G | Hap1 | |||||||||
| JL039 | C:C | 1 | JL123 | G | Hap96 | |||||||||
| 369 | C:C | 1 | JL124 | G | Hap4 | |||||||||
| 432 | C:C | 1 | JL126 | G | Hap97 | |||||||||
| 390 | C:C | 1 | JL132 | G | Hap6 | |||||||||
| H166 | C:C | 1 | JL133 | G | Hap4 | |||||||||
| JL134 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL135 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL136 | G | Hap51 | ||||||||||||
| JL137 | G | Hap99 | ||||||||||||
| JL138 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL140 | G | Hap100 | ||||||||||||
| JL141 | G | Hap101 | ||||||||||||
| JL142 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL144 | G | Hap103 | ||||||||||||
| JL145 | G | Hap17 | ||||||||||||
| JL148 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL149 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL151 | G | Hap17 | ||||||||||||
| JL152 | G | Hap105 | ||||||||||||
| JL153 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL156 | G | Hap108 | ||||||||||||
| JL158 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL159 | G | Hap41 | ||||||||||||
| JL160 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL161 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL162 | G | Hap19 | ||||||||||||
| JL163 | G | Hap18 | ||||||||||||
| JL164 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL165 | G | Hap16 | ||||||||||||
| JL166 | G | Hap17 | ||||||||||||
| JL167 | G | Hap6 | ||||||||||||
| JL168 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL169 | G | Hap109 | ||||||||||||
| JL170 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL171 | G | Hap110 | ||||||||||||
| JL172 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL173 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL175 | G | Hap28 | ||||||||||||
| JL176 | G | Hap53 | ||||||||||||
| JL177 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL180 | G | Hap26 | ||||||||||||
| JL181 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL183 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL186 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL187 | G | Hap7 | ||||||||||||
| JL188 | G | Hap15 | ||||||||||||
| JL189 | G | Hap112 | ||||||||||||
| JL192 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL193 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL196 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL197 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL198 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL200 | G | Hap16 | ||||||||||||
| JL201 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL204 | G | Hap13 | ||||||||||||
| JL205 | G | Hap114 | ||||||||||||
| JL207 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL209 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL211 | G | Hap16 | ||||||||||||
| JL214 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL216 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL217 | G | Hap7 | ||||||||||||
| JL218 | G | Hap117 | ||||||||||||
| JL220 | G | Hap45 | ||||||||||||
| JL221 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL223 | G | Hap36 | ||||||||||||
| JL224 | G | Hap118 | ||||||||||||
| JL227 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL228 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL229 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL230 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL231 | G | Hap16 | ||||||||||||
| JL232 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL233 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL234 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL235 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL236 | G | Hap28 | ||||||||||||
| JL237 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL238 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL240 | G | Hap121 | ||||||||||||
| JL241 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL242 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL243 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL244 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL245 | G | Hap8 | ||||||||||||
| JL246 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL247 | G | Hap122 | ||||||||||||
| JL248 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL249 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL250 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL252 | G | Hap17 | ||||||||||||
| JL254 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL255 | G | Hap17 | ||||||||||||
| JL257 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL258 | G | Hap124 | ||||||||||||
| JL259 | G | Hap125 | ||||||||||||
| JL260 | G | Hap126 | ||||||||||||
| JL262 | G | Hap127 | ||||||||||||
| JL266 | G | Hap129 | ||||||||||||
| JL268 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL270 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL272 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL274 | G | Hap28 | ||||||||||||
| JL275 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL276 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL277 | G | Hap6 | ||||||||||||
| JL278 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL279 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL280 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL282 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL284 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL285 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL286 | G | Hap6 | ||||||||||||
| JL287 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL290 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL292 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL293 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL295 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL296 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL297 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL298 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL299 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL300 | G | Hap132 | ||||||||||||
| JL304 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL306 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL307 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL308 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL310 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL312 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL313 | G | Hap136 | ||||||||||||
| JL314 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL315 | G | Hap39 | ||||||||||||
| JL316 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL317 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL318 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL319 | G | Hap26 | ||||||||||||
| JL320 | G | Hap14 | ||||||||||||
| JL321 | G | Hap13 | ||||||||||||
| JL322 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL323 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL324 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL325 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL326 | G | Hap44 | ||||||||||||
| JL327 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL328 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL329 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL333 | G | Hap6 | ||||||||||||
| JL335 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL338 | G | Hap1 | ||||||||||||
| JL339 | G | Hap45 | ||||||||||||
| JL340 | G | Hap2 | ||||||||||||
| JL341 | G | Hap139 | ||||||||||||
| JL342 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL343 | G | Hap5 | ||||||||||||
| JL344 | G | Hap141 | ||||||||||||
| JL345 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL346 | G | Hap4 | ||||||||||||
| JL350 | G | Hap145 | ||||||||||||